160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1065 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 339 aa  696    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  58.43 
 
 		 344 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  46.09 
 
 		 344 aa  322  6e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  45.43 
 
 		 341 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  43.81 
 
 		 334 aa  295  5e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  45.65 
 
 		 331 aa  291  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  41.54 
 
 		 336 aa  279  4e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  41.54 
 
 		 341 aa  278  7e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  40.84 
 
 		 338 aa  262  6.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  36.84 
 
 		 335 aa  224  1e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  27.69 
 
 		 350 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  29.9 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  30.22 
 
 		 331 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  28.21 
 
 		 338 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  28.8 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  27.89 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  29.26 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  28.89 
 
 		 348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  29.26 
 
 		 329 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  26.52 
 
 		 344 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  26.57 
 
 		 336 aa  112  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  26.27 
 
 		 336 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  26.27 
 
 		 336 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  26.27 
 
 		 336 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  26.27 
 
 		 336 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  26.57 
 
 		 336 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  26.57 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  26.27 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  25.37 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  25.3 
 
 		 330 aa  110  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  26.27 
 
 		 336 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  26.27 
 
 		 336 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  24.3 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  28.47 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1965  DNA polymerase III, delta subunit  27.13 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2304  DNA polymerase III, delta subunit  27.5 
 
 		 357 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477598  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0224  DNA polymerase III, delta subunit  25.75 
 
 		 346 aa  97.4  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2577  DNA polymerase III, delta subunit  25.07 
 
 		 346 aa  97.4  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0260  DNA polymerase III, delta subunit  25.82 
 
 		 346 aa  96.7  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  28.96 
 
 		 346 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2150  DNA polymerase III, delta subunit  25.98 
 
 		 348 aa  92  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  21.53 
 
 		 378 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2201  DNA polymerase III, delta subunit  25.53 
 
 		 348 aa  87.4  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.638698 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  24.35 
 
 		 374 aa  87  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  27.43 
 
 		 334 aa  85.9  9e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  27.56 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  26.13 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  24.59 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  23.49 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  24.92 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  24.45 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  21.85 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  24.6 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  26.07 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  21.62 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  23.66 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  22.95 
 
 		 323 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  22.46 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  22.11 
 
 		 330 aa  65.9  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  22.36 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  22.36 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0072  DNA polymerase III subunit delta  27.19 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6001  DNA polymerase III subunit delta  21.49 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  25.33 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  22.73 
 
 		 328 aa  62  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  22.46 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  22.66 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  24.71 
 
 		 338 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0424  DNA polymerase III subunit delta  22.12 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.813345  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  25.51 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2001  DNA polymerase III, delta subunit  27.11 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.152484  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4600  DNA polymerase III subunit delta  19.88 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  25.1 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3769  DNA polymerase III subunit delta  22.69 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  26.25 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  20.62 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  23.76 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3915  DNA polymerase III subunit delta  22.47 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  25.7 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2834  DNA polymerase III, delta subunit  28.65 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.68901 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3264  DNA polymerase III subunit delta  22.47 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0083  DNA polymerase III subunit delta  22.73 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  21.56 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0551  DNA polymerase III subunit delta  21.7 
 
 		 364 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0556298  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  23.55 
 
 		 329 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00831  DNA polymerase III subunit delta  28.8 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  23.53 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0173  DNA polymerase III subunit delta  21.37 
 
 		 364 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0656  DNA polymerase III subunit delta  21.37 
 
 		 364 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121282  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  20.81 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0577  DNA polymerase III subunit delta  21.7 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4546  DNA polymerase III subunit delta  21.59 
 
 		 348 aa  54.3  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0964  DNA polymerase III subunit delta  23.01 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2910  DNA polymerase III subunit delta  24.44 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  20.91 
 
 		 345 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  23.08 
 
 		 342 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2832  DNA polymerase III subunit delta  21.46 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3742  DNA polymerase III subunit delta  21.37 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0768215 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2277  DNA-directed DNA polymerase  21.08 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2346  DNA polymerase III subunit delta  23.08 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>