187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2110 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 336 aa  688    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  51.2 
 
 		 338 aa  361  8e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  48.63 
 
 		 331 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  47.4 
 
 		 329 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  47.71 
 
 		 329 aa  324  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  45.59 
 
 		 334 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  43.36 
 
 		 337 aa  301  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  36.47 
 
 		 330 aa  224  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  29.48 
 
 		 332 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  27.81 
 
 		 350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  28.62 
 
 		 344 aa  143  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  27.76 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  28.03 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  28.08 
 
 		 348 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  26.49 
 
 		 331 aa  123  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  28.09 
 
 		 330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  27.37 
 
 		 338 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  27.56 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  25.15 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  27.12 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  23.12 
 
 		 341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  25.32 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  27.47 
 
 		 346 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  23.85 
 
 		 378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  30.28 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  27.51 
 
 		 338 aa  109  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  28.17 
 
 		 346 aa  109  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  25.87 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  25.87 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  24.3 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  25.87 
 
 		 336 aa  106  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  25.87 
 
 		 336 aa  105  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  25.87 
 
 		 336 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  25.87 
 
 		 336 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  25.87 
 
 		 336 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  25.87 
 
 		 336 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  25.87 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  24.12 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  25.24 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  27.04 
 
 		 324 aa  102  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  26.07 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  24.61 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  25.78 
 
 		 341 aa  100  5e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  26.46 
 
 		 354 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  23.29 
 
 		 325 aa  98.2  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  27.39 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1965  DNA polymerase III, delta subunit  25.61 
 
 		 349 aa  96.7  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  25.16 
 
 		 328 aa  96.3  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  23.78 
 
 		 325 aa  95.9  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  29.71 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0260  DNA polymerase III, delta subunit  27.36 
 
 		 346 aa  94.7  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  25.87 
 
 		 315 aa  92.4  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2201  DNA polymerase III, delta subunit  24.24 
 
 		 348 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.638698 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2150  DNA polymerase III, delta subunit  25.23 
 
 		 348 aa  89.7  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0224  DNA polymerase III, delta subunit  26.2 
 
 		 346 aa  89  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2577  DNA polymerase III, delta subunit  25.38 
 
 		 346 aa  88.6  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  23.13 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  23.82 
 
 		 342 aa  87.8  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  22.5 
 
 		 323 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  23.7 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  24.77 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2450  DNA polymerase III delta  30.13 
 
 		 458 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  25.16 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  21.59 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  21.59 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2304  DNA polymerase III, delta subunit  23.95 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477598  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  26.42 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  25.48 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1185  DNA polymerase III, delta subunit  22.78 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1313  DNA polymerase III, delta  33.73 
 
 		 465 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  25.47 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2547  DNA polymerase III delta  33.13 
 
 		 465 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0981779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2643  DNA polymerase III delta  33.13 
 
 		 465 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.640938  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  20.73 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  21.1 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  26.38 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  20.73 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  25.5 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  23.59 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0811  DNA polymerase III, delta subunit  27.23 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.692629 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  24.92 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  21.32 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  25.62 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  25.53 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  25.53 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0083  DNA polymerase III subunit delta  26.8 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  22.5 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  23.05 
 
 		 344 aa  67  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5512  DNA polymerase III, delta subunit  23.4 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.504789 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1188  DNA polymerase III delta  27.55 
 
 		 481 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  22.78 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  26.28 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2143  DNA polymerase III, delta subunit  23.72 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  25.98 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  24.7 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  23.47 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  21.56 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  22.56 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  24.93 
 
 		 328 aa  62  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  21.86 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>