70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_12630 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  637    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1206  hypothetical protein  72.52 
 
 		 322 aa  433  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  54.82 
 
 		 329 aa  332  7.000000000000001e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  55.03 
 
 		 319 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3913  hypothetical protein  53.04 
 
 		 316 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  52.32 
 
 		 330 aa  294  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2664  hypothetical protein  54.75 
 
 		 319 aa  287  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3511  hypothetical protein  52.4 
 
 		 320 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3523  hypothetical protein  52.4 
 
 		 320 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.360312  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3583  hypothetical protein  52.4 
 
 		 320 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal  0.0173863 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  48.73 
 
 		 326 aa  282  7.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3846  DNA polymerase III, delta subunit  49.84 
 
 		 326 aa  281  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  49.69 
 
 		 319 aa  269  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12441  hypothetical protein  52.87 
 
 		 322 aa  268  8e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  46.89 
 
 		 325 aa  265  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2801  DNA polymerase III delta  51.09 
 
 		 301 aa  263  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0823  DNA polymerase III, delta subunit  50.15 
 
 		 346 aa  257  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00704203  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3186  DNA polymerase III delta  47.13 
 
 		 324 aa  253  3e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  47.84 
 
 		 327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  49.38 
 
 		 335 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  48.31 
 
 		 320 aa  250  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1259  DNA polymerase III, delta subunit  46.98 
 
 		 334 aa  229  4e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.098932 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  40.18 
 
 		 330 aa  217  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2104  DNA polymerase III, delta subunit  49.68 
 
 		 333 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  41.05 
 
 		 342 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13290  DNA polymerase III, delta subunit  42.81 
 
 		 334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  43.04 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1739  DNA polymerase III, delta subunit  43.31 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  40 
 
 		 317 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  41.77 
 
 		 343 aa  202  6e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  39.74 
 
 		 317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  39.68 
 
 		 317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2208  DNA polymerase III, delta subunit  42.9 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2228  DNA polymerase III, delta subunit  45.28 
 
 		 310 aa  184  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12440  DNA polymerase III, delta subunit  38.12 
 
 		 339 aa  161  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203264  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17400  DNA polymerase III, delta subunit  37.04 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  32.48 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0941  putative DNA polymerase III, delta subunit  29.2 
 
 		 348 aa  109  5e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  28.35 
 
 		 329 aa  85.9  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  27.52 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  23.77 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  25.78 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  25.5 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  25.47 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  25.85 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  26.48 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  24.84 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  28.09 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  23.7 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  23.03 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  23.13 
 
 		 334 aa  53.9  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  23.53 
 
 		 344 aa  53.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  25.2 
 
 		 336 aa  53.5  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  26.17 
 
 		 336 aa  53.1  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  26.25 
 
 		 330 aa  52.8  0.000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  25.39 
 
 		 346 aa  52.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  27.78 
 
 		 315 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  22.84 
 
 		 330 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  26.89 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  22.7 
 
 		 332 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  24.46 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2277  DNA-directed DNA polymerase  30.61 
 
 		 344 aa  49.3  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  21.27 
 
 		 334 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0481  DNA polymerase III subunit delta  27.11 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  19.88 
 
 		 328 aa  47  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  24.85 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  26.84 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0729  hypothetical protein  20.93 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0375317  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  20.73 
 
 		 343 aa  43.1  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  18.73 
 
 		 337 aa  42.4  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>