89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2243 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 317 aa  634    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  82.22 
 
 		 317 aa  527  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1739  DNA polymerase III, delta subunit  54.9 
 
 		 334 aa  320  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13290  DNA polymerase III, delta subunit  54.6 
 
 		 334 aa  310  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  52.58 
 
 		 330 aa  307  1.0000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2208  DNA polymerase III, delta subunit  53.21 
 
 		 339 aa  302  6.000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2228  DNA polymerase III, delta subunit  54.52 
 
 		 310 aa  291  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12440  DNA polymerase III, delta subunit  49.53 
 
 		 339 aa  275  6e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203264  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  46.79 
 
 		 343 aa  256  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  44.44 
 
 		 325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  45.63 
 
 		 326 aa  241  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3846  DNA polymerase III, delta subunit  45.31 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  42.48 
 
 		 317 aa  233  3e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  43 
 
 		 319 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  42.9 
 
 		 319 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  45.28 
 
 		 327 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  46.23 
 
 		 335 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17400  DNA polymerase III, delta subunit  44.83 
 
 		 328 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  41.8 
 
 		 320 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  39.68 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  38.1 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  39.94 
 
 		 329 aa  190  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1206  hypothetical protein  39.48 
 
 		 322 aa  186  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3913  hypothetical protein  38.73 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3523  hypothetical protein  37.86 
 
 		 320 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.360312  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3511  hypothetical protein  37.86 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3583  hypothetical protein  37.86 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal  0.0173863 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0823  DNA polymerase III, delta subunit  40.38 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00704203  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2801  DNA polymerase III delta  38.57 
 
 		 301 aa  174  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2664  hypothetical protein  36.89 
 
 		 319 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12441  hypothetical protein  37.54 
 
 		 322 aa  170  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  34.29 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1259  DNA polymerase III, delta subunit  40.13 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.098932 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  37.5 
 
 		 342 aa  159  8e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2104  DNA polymerase III, delta subunit  40.73 
 
 		 333 aa  149  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  34.3 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0941  putative DNA polymerase III, delta subunit  31.14 
 
 		 348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3186  DNA polymerase III delta  35.31 
 
 		 324 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  27.64 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  25.98 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  26.14 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  24.12 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  24.85 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  28.69 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  24.12 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  26.1 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0729  hypothetical protein  23.15 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0375317  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  23.7 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  23.9 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  23.64 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  28.87 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  26.43 
 
 		 330 aa  57  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  23.7 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  24.13 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  25.16 
 
 		 336 aa  53.5  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  26.27 
 
 		 348 aa  52.8  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  25.34 
 
 		 338 aa  52.8  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  26.7 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  22.99 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  22.61 
 
 		 336 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  24.53 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  22.99 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  21.12 
 
 		 324 aa  49.7  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  24.37 
 
 		 312 aa  49.7  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  22.61 
 
 		 336 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  23.67 
 
 		 336 aa  49.3  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2143  DNA polymerase III, delta subunit  28.66 
 
 		 334 aa  49.3  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  23.99 
 
 		 328 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  22.61 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  23.23 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  22.61 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  22.61 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  22.61 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  22.61 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  23.14 
 
 		 332 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  20.34 
 
 		 324 aa  47  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  21.13 
 
 		 325 aa  47.4  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  20.34 
 
 		 324 aa  47  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  22.39 
 
 		 330 aa  45.8  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0457  DNA polymerase III, delta subunit  26.12 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4252  DNA polymerase III subunit delta  23.75 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.400931 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0617  DNA polymerase III, delta subunit  26.12 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.733396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3310  DNA polymerase III subunit delta  22.96 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  18.97 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2157  DNA polymerase III, delta subunit  35.14 
 
 		 338 aa  43.9  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  23.27 
 
 		 344 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  21.14 
 
 		 350 aa  43.5  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  29.13 
 
 		 344 aa  43.1  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2971  DNA polymerase III subunit delta  25.48 
 
 		 356 aa  42.7  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>