123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1679 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 		 324 aa  651    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 		 324 aa  651    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  75.62 
 
 		 324 aa  496  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  36.51 
 
 		 344 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  38.94 
 
 		 336 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  38.63 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  39.54 
 
 		 336 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  38.32 
 
 		 336 aa  210  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  39.54 
 
 		 336 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  38.63 
 
 		 336 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  39.54 
 
 		 336 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  38.32 
 
 		 336 aa  210  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  38.32 
 
 		 336 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  38.32 
 
 		 336 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  33.65 
 
 		 348 aa  208  9e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  37.85 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  25.24 
 
 		 343 aa  149  7e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  28.35 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  31.21 
 
 		 334 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  29.05 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  28.04 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  25.24 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  27.48 
 
 		 338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  24.29 
 
 		 331 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  25.26 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  26.5 
 
 		 330 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  24.62 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1819  DNA polymerase III subunit delta  28.04 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0075815  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  24 
 
 		 337 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  25.36 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  23.87 
 
 		 346 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  24.68 
 
 		 329 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  25.16 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  25.09 
 
 		 331 aa  102  6e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  22.15 
 
 		 339 aa  99  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  24.37 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  26.81 
 
 		 345 aa  96.7  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  24.69 
 
 		 334 aa  93.6  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  21.14 
 
 		 332 aa  93.2  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  21.17 
 
 		 335 aa  92.4  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  21.59 
 
 		 336 aa  91.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  23.44 
 
 		 332 aa  89.4  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  24.92 
 
 		 348 aa  89  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  24.3 
 
 		 348 aa  87  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1173  DNA polymerase III, delta subunit  27.5 
 
 		 329 aa  86.3  6e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163613  hitchhiker  0.0000000248106 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  22.22 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  19.94 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  21.65 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1185  DNA polymerase III, delta subunit  26.51 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl368  hypothetical protein  22.86 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.42314e-33  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  23.25 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  25.31 
 
 		 338 aa  79.3  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  22.26 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  22.29 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  18.33 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0772  hypothetical protein  24 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.421798  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  25.49 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  26.02 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  23.96 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  18.81 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  21.97 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  23.96 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  21.79 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  22.36 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  23.67 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  23.1 
 
 		 419 aa  69.7  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  21.33 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  20.79 
 
 		 336 aa  67  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  24.03 
 
 		 328 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  22.65 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  20.69 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  23.28 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0811  DNA polymerase III, delta subunit  23.61 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.692629 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  24.74 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  22.65 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  28.73 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1188  DNA polymerase III delta  26.86 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  19.55 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  24.21 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2450  DNA polymerase III delta  23.37 
 
 		 458 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0179  DNA polymerase III, delta subunit  27.15 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  22.95 
 
 		 323 aa  57  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  25 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  20.52 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  22.73 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  21.94 
 
 		 330 aa  53.5  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2547  DNA polymerase III delta  21.03 
 
 		 465 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0981779  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1313  DNA polymerase III, delta  21.46 
 
 		 465 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0335  DNA polymerase III, delta subunit superfamily  22.44 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.874049  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2643  DNA polymerase III delta  21.05 
 
 		 465 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.640938  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1245  DNA polymerase III subunit delta  22.44 
 
 		 342 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  18.15 
 
 		 342 aa  50.1  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1652  DNA polymerase III subunit delta  19.73 
 
 		 343 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.884155 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3310  DNA polymerase III subunit delta  24.47 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  25.49 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  22.82 
 
 		 351 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  25.49 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  24.26 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  20.96 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>