76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17390 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 317 aa  625  1e-178  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  42.41 
 
 		 330 aa  245  6e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  42.67 
 
 		 317 aa  237  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1739  DNA polymerase III, delta subunit  45.86 
 
 		 334 aa  235  6e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  42.48 
 
 		 317 aa  233  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13290  DNA polymerase III, delta subunit  43.04 
 
 		 334 aa  225  7e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2208  DNA polymerase III, delta subunit  44.05 
 
 		 339 aa  224  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  43.93 
 
 		 343 aa  222  4.9999999999999996e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2228  DNA polymerase III, delta subunit  47.02 
 
 		 310 aa  220  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  40.45 
 
 		 319 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  41.04 
 
 		 326 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  38.73 
 
 		 325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  39.74 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12440  DNA polymerase III, delta subunit  42.48 
 
 		 339 aa  197  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203264  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3846  DNA polymerase III, delta subunit  40.65 
 
 		 326 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  40.98 
 
 		 319 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1206  hypothetical protein  39.1 
 
 		 322 aa  185  9e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17400  DNA polymerase III, delta subunit  40.13 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  36.77 
 
 		 327 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  37.42 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1259  DNA polymerase III, delta subunit  39.1 
 
 		 334 aa  175  8e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.098932 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  39.31 
 
 		 320 aa  168  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  38.39 
 
 		 335 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0823  DNA polymerase III, delta subunit  39.75 
 
 		 346 aa  165  9e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00704203  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2104  DNA polymerase III, delta subunit  41.04 
 
 		 333 aa  165  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3523  hypothetical protein  36.66 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.360312  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3583  hypothetical protein  36.66 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal  0.0173863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3511  hypothetical protein  36.66 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3913  hypothetical protein  35.05 
 
 		 316 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2664  hypothetical protein  35.74 
 
 		 319 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2801  DNA polymerase III delta  36.17 
 
 		 301 aa  153  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  38.1 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  33.02 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12441  hypothetical protein  34.38 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  34.59 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3186  DNA polymerase III delta  36.54 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  30.06 
 
 		 323 aa  132  7.999999999999999e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0941  putative DNA polymerase III, delta subunit  26.97 
 
 		 348 aa  116  6e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  26.32 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  21.32 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  26.86 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  23.2 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  23.2 
 
 		 336 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  25.15 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  22.56 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  22.88 
 
 		 336 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  22.88 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  22.88 
 
 		 336 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  20.38 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  22.88 
 
 		 336 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  26.69 
 
 		 336 aa  53.9  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  24.41 
 
 		 344 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  23.2 
 
 		 336 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  21.28 
 
 		 344 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  20.39 
 
 		 331 aa  53.5  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  22.88 
 
 		 336 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  22.88 
 
 		 336 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  26.97 
 
 		 323 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  21.67 
 
 		 332 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  23.49 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  23.4 
 
 		 323 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  24.63 
 
 		 334 aa  50.4  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  21.74 
 
 		 343 aa  49.3  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  27.91 
 
 		 315 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  19.66 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  23.4 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  24.36 
 
 		 335 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0828  DNA polymerase III delta  18.75 
 
 		 323 aa  47.4  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  26.74 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2524  DNA polymerase III, delta subunit  25.36 
 
 		 311 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  19.02 
 
 		 328 aa  46.2  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  21.76 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  24.32 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  26.22 
 
 		 324 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  26.39 
 
 		 306 aa  43.1  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  21.73 
 
 		 324 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>