138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3075 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 315 aa  626  1e-178  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  82.22 
 
 		 354 aa  522  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  62.1 
 
 		 324 aa  382  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  47.8 
 
 		 323 aa  273  4.0000000000000004e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  31.79 
 
 		 330 aa  139  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  29.65 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  33 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  29.03 
 
 		 346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  30.7 
 
 		 334 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  26.58 
 
 		 331 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  28.48 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  29.11 
 
 		 344 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  27.99 
 
 		 342 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  30.77 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  29.97 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  28.57 
 
 		 336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  28.57 
 
 		 336 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  28.57 
 
 		 336 aa  119  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  28.57 
 
 		 336 aa  119  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  28.57 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  28.57 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  27.86 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  28.25 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  28.25 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  27.57 
 
 		 419 aa  116  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  28.25 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  28.25 
 
 		 336 aa  116  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  28.25 
 
 		 336 aa  116  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  25.64 
 
 		 325 aa  116  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  26.23 
 
 		 337 aa  115  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  28.48 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 		 323 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  26.69 
 
 		 399 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  25.63 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  28.83 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  31.19 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  27.12 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  28.12 
 
 		 332 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  23.71 
 
 		 338 aa  98.2  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  29.24 
 
 		 306 aa  97.4  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  28.29 
 
 		 338 aa  95.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  28.67 
 
 		 338 aa  95.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  26.84 
 
 		 331 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  27.94 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  25.87 
 
 		 336 aa  92.4  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  25.5 
 
 		 348 aa  89.4  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  25.17 
 
 		 348 aa  88.2  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  21.74 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  28.25 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  25.95 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  28.62 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  26.28 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  24.05 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  22.98 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  23.53 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  28.78 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  22.29 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  22.29 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0481  DNA polymerase III, delta subunit  30.77 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  24.85 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  21.85 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  22.9 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1185  DNA polymerase III, delta subunit  22.09 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  24.85 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2917  DNA polymerase III, delta subunit  25.25 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  21.36 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  26.77 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1965  DNA polymerase III, delta subunit  24.56 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  22.35 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  23.76 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1564  DNA polymerase III, delta subunit  25.91 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  21.71 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  28.57 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  28.49 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  26.22 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1404  DNA polymerase III, delta subunit  25.84 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2346  DNA polymerase III subunit delta  28.17 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  20.98 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  25.77 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1739  DNA polymerase III subunit delta  22.22 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.353532  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  24.52 
 
 		 345 aa  53.9  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2304  DNA polymerase III, delta subunit  24.26 
 
 		 357 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477598  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18371  DNA polymerase III subunit delta  21.64 
 
 		 333 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.926744  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  26.37 
 
 		 330 aa  53.1  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2450  DNA polymerase III delta  30.29 
 
 		 458 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1173  DNA polymerase III, delta subunit  24.27 
 
 		 329 aa  52.8  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163613  hitchhiker  0.0000000248106 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1819  DNA polymerase III subunit delta  25.32 
 
 		 334 aa  52.4  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0075815  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  27.49 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3629  DNA polymerase III subunit delta  27.17 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.628858  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1185  DNA polymerase III subunit delta  23.58 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  27.78 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3704  DNA polymerase III, delta subunit  23.89 
 
 		 346 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000203003  decreased coverage  0.000000325428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  23.33 
 
 		 346 aa  50.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3146  DNA polymerase III subunit delta  23.17 
 
 		 341 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18561  DNA polymerase III subunit delta  21.64 
 
 		 333 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.318986  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2834  DNA polymerase III, delta subunit  26.73 
 
 		 325 aa  49.7  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.68901 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  27.91 
 
 		 317 aa  49.3  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  27.08 
 
 		 321 aa  49.3  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0292  DNA polymerase III subunit delta  28.37 
 
 		 343 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.259297  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1313  DNA polymerase III, delta  34.69 
 
 		 465 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>