66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2304 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2304  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 357 aa  733    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477598  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2577  DNA polymerase III, delta subunit  71.3 
 
 		 346 aa  504  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2150  DNA polymerase III, delta subunit  68.13 
 
 		 348 aa  495  1e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0260  DNA polymerase III, delta subunit  64.35 
 
 		 346 aa  462  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1965  DNA polymerase III, delta subunit  61.11 
 
 		 349 aa  456  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0224  DNA polymerase III, delta subunit  63.14 
 
 		 346 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2201  DNA polymerase III, delta subunit  59.21 
 
 		 348 aa  430  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.638698 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  25.71 
 
 		 344 aa  106  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  26.38 
 
 		 350 aa  106  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  26.8 
 
 		 344 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  25.08 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  27.5 
 
 		 339 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  27.05 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  25.38 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  24.5 
 
 		 334 aa  92.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  27.11 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  23.84 
 
 		 337 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  25.31 
 
 		 341 aa  90.1  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  24.77 
 
 		 329 aa  87.8  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  24.53 
 
 		 331 aa  86.3  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  24.3 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  23.98 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  23.95 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  30.34 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  24.68 
 
 		 338 aa  72  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  25.46 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  24.76 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  23.14 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  23.56 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  24.72 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  22.96 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  22.96 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  22.96 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  22.96 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  22.96 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  22.96 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  22.96 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  26.5 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  25.66 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  22.66 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  22.66 
 
 		 336 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  22.05 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  24.46 
 
 		 334 aa  54.3  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  24.26 
 
 		 315 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  23.57 
 
 		 338 aa  53.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  26.29 
 
 		 342 aa  50.4  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2001  DNA polymerase III, delta subunit  20.07 
 
 		 341 aa  50.4  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.152484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  26.39 
 
 		 339 aa  49.7  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  25.51 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  24.38 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  24.73 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  25.22 
 
 		 342 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  25.43 
 
 		 419 aa  46.2  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  24.19 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  21.69 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  24.18 
 
 		 351 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  23.77 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  24.19 
 
 		 351 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  20.74 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  25.1 
 
 		 345 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  22.46 
 
 		 328 aa  43.9  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  24.12 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  25.21 
 
 		 345 aa  43.1  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  24.79 
 
 		 348 aa  43.5  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0811  DNA polymerase III, delta subunit  34.94 
 
 		 387 aa  43.1  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.692629 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>