124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1954 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 339 aa  683    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  47.34 
 
 		 342 aa  317  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  30.63 
 
 		 325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  31.78 
 
 		 378 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  32.73 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  31.52 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  30.21 
 
 		 334 aa  142  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  29.69 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  28.17 
 
 		 354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  28.48 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  32.53 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  25.82 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  25.82 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  24.25 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  26.23 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  25.22 
 
 		 336 aa  123  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  25.22 
 
 		 336 aa  123  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  24.93 
 
 		 336 aa  123  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  24.76 
 
 		 335 aa  123  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  23.62 
 
 		 337 aa  123  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  25.22 
 
 		 336 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  25.22 
 
 		 336 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  25.22 
 
 		 336 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  25.22 
 
 		 336 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  25.22 
 
 		 336 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  25.22 
 
 		 336 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  24.84 
 
 		 329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  25.69 
 
 		 330 aa  119  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  23.46 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  26.09 
 
 		 336 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  24.23 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  25.83 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  24.32 
 
 		 344 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  22.82 
 
 		 338 aa  106  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  25.23 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  25.57 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  23.87 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  25 
 
 		 348 aa  102  9e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  26.07 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  24.78 
 
 		 335 aa  96.3  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1185  DNA polymerase III, delta subunit  27.18 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  22.75 
 
 		 330 aa  94  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  22.79 
 
 		 338 aa  89.7  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  22.82 
 
 		 332 aa  89.4  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  22.15 
 
 		 324 aa  89.4  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  22.15 
 
 		 324 aa  89.4  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  25.17 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  23.08 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  23.31 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  24.13 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  24.26 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  23.82 
 
 		 342 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1819  DNA polymerase III subunit delta  23.9 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0075815  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  24.28 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  18.79 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  23.91 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  23.67 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  23.81 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  24.68 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  21.85 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  21.85 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  23.89 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  20.8 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1188  DNA polymerase III delta  28.21 
 
 		 481 aa  69.7  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  24.48 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0224  DNA polymerase III, delta subunit  23.37 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  22.49 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  21.99 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  22.5 
 
 		 342 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl368  hypothetical protein  20.39 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.42314e-33  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  21.53 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  23.26 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  20 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  20.91 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1508  DNA polymerase III, delta subunit  21.61 
 
 		 339 aa  59.3  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0182978  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0671  DNA polymerase III, delta subunit  21.61 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00374825  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2524  DNA polymerase III, delta subunit  27.27 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  25.97 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  22.38 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2150  DNA polymerase III, delta subunit  25.43 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  21.66 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  22.38 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1965  DNA polymerase III, delta subunit  23.88 
 
 		 349 aa  57  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  22.07 
 
 		 336 aa  57  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0072  DNA polymerase III subunit delta  22.92 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  22.29 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  21.45 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2277  DNA-directed DNA polymerase  19.23 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0260  DNA polymerase III, delta subunit  24.69 
 
 		 346 aa  54.7  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0234  DNA polymerase III, delta subunit  18.53 
 
 		 353 aa  55.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  23.1 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  21.88 
 
 		 334 aa  53.9  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  22.46 
 
 		 329 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  19.15 
 
 		 344 aa  53.1  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2586  DNA polymerase III subunit delta  19.6 
 
 		 375 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000748546 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  21.79 
 
 		 327 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0481  DNA polymerase III subunit delta  18.32 
 
 		 362 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0256  DNA polymerase III, delta subunit  18.66 
 
 		 353 aa  52  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  21.79 
 
 		 327 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2443  DNA polymerase III, delta subunit  18.3 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>