84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2007 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 336 aa  681    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  29.85 
 
 		 344 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  30.49 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  29.12 
 
 		 336 aa  116  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  29.12 
 
 		 336 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  29.12 
 
 		 336 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  28.82 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  28.53 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  29.7 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  28.82 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  28.82 
 
 		 336 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  28.82 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  27.94 
 
 		 336 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  28.99 
 
 		 336 aa  113  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  25.66 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  24.49 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  25.86 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  24.71 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  31.19 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  25.77 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  29.92 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  27.96 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  28.78 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  20.56 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  22.84 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  21.65 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  21.65 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  24.52 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  22.84 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  24.1 
 
 		 334 aa  67  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  23.98 
 
 		 346 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  28.63 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  25.16 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1173  DNA polymerase III, delta subunit  23.23 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163613  hitchhiker  0.0000000248106 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  26.87 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  20.75 
 
 		 335 aa  62  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  20.36 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  29.88 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  25.79 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1819  DNA polymerase III subunit delta  22.44 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0075815  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  28.05 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  21.66 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  33.57 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  29.33 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  28.52 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  26.69 
 
 		 317 aa  53.9  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  27.73 
 
 		 345 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  21.6 
 
 		 334 aa  53.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  25.56 
 
 		 345 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  26.17 
 
 		 326 aa  53.1  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  28.4 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  29.5 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0542  DNA polymerase III subunit delta  26.09 
 
 		 320 aa  52  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2524  DNA polymerase III, delta subunit  30.52 
 
 		 311 aa  50.1  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  28.91 
 
 		 344 aa  49.7  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1930  DNA polymerase III delta  21.12 
 
 		 321 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00737769  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  25.97 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0339  DNA polymerase III, delta subunit  27.27 
 
 		 338 aa  47  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00729017 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  25.12 
 
 		 324 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  24.16 
 
 		 344 aa  47  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  22.87 
 
 		 325 aa  47.4  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  23.38 
 
 		 341 aa  47  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  24.04 
 
 		 337 aa  46.2  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  23.21 
 
 		 550 aa  46.2  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  27.86 
 
 		 351 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  19.05 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2277  DNA-directed DNA polymerase  27.6 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  24.03 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  24.56 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  27.96 
 
 		 327 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2910  DNA polymerase III subunit delta  26.21 
 
 		 345 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  20.74 
 
 		 378 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  27.36 
 
 		 345 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  27.36 
 
 		 345 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0828  DNA polymerase III delta  22.09 
 
 		 323 aa  43.5  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  25.08 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08980  DNA polymerase III subunit delta  27.95 
 
 		 346 aa  43.5  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0881789  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  24.52 
 
 		 331 aa  43.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  27.11 
 
 		 320 aa  43.5  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  27.36 
 
 		 351 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  21.34 
 
 		 331 aa  42.7  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  20 
 
 		 325 aa  42.7  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0179  DNA polymerase III, delta subunit  23.23 
 
 		 331 aa  42.7  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1451  DNA polymerase III subunit delta  25.51 
 
 		 334 aa  42.7  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0184698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>