64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1920 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 335 aa  673    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  29.82 
 
 		 342 aa  123  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  26.75 
 
 		 325 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  26.82 
 
 		 346 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  24.78 
 
 		 339 aa  96.3  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  24.02 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  23.38 
 
 		 348 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  22.6 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  22.29 
 
 		 354 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  23.94 
 
 		 378 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  23.75 
 
 		 324 aa  90.1  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  20.89 
 
 		 329 aa  89.7  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  23.05 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  23.05 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  23.05 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  23.05 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  21.24 
 
 		 335 aa  87.8  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  23.46 
 
 		 336 aa  86.7  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  21 
 
 		 332 aa  85.9  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  21.74 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  22.99 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  22.75 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  22.69 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  22.69 
 
 		 336 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  22.16 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  21.26 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  19.33 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  21.3 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  23.14 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  23.1 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  21.52 
 
 		 338 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  25.52 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  18.67 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  21.45 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  21.32 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  20.06 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  21.71 
 
 		 350 aa  67  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  20.12 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  17.37 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  22.7 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  20.75 
 
 		 336 aa  62  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  20.28 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  20.28 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  21.45 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0179  DNA polymerase III, delta subunit  23.43 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  20.46 
 
 		 328 aa  59.3  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  19.51 
 
 		 330 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  18.02 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  19.16 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  21.59 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  21.72 
 
 		 328 aa  54.3  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  21.85 
 
 		 374 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  20.7 
 
 		 341 aa  47.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  19.77 
 
 		 339 aa  47  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  21.16 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  20.65 
 
 		 323 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  24.7 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2917  DNA polymerase III, delta subunit  22.58 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1185  DNA polymerase III, delta subunit  21.66 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  21.65 
 
 		 344 aa  43.9  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  22.54 
 
 		 323 aa  43.5  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  17.87 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  20.63 
 
 		 312 aa  43.1  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  19.14 
 
 		 344 aa  42.7  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>