109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1655 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 328 aa  667    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  55.87 
 
 		 330 aa  374  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  55.03 
 
 		 327 aa  346  3e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  37.74 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  29.11 
 
 		 332 aa  105  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  25.24 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  28.77 
 
 		 337 aa  96.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  29.48 
 
 		 334 aa  95.5  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  25.83 
 
 		 334 aa  93.2  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  26.6 
 
 		 329 aa  92.8  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  26.92 
 
 		 329 aa  89.7  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  28.48 
 
 		 354 aa  85.9  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  22.77 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  29.07 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  22.46 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  22.46 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  22.15 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  22.15 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  22.15 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  22.15 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  21.98 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  22.15 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  22.15 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  25.6 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  28.25 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  22.11 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  25.16 
 
 		 334 aa  75.9  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  25.26 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  24.6 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  21.47 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  22.61 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  22.44 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  25.89 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  22.41 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  25.65 
 
 		 348 aa  69.3  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  25.86 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  22.96 
 
 		 344 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  22.5 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  28.91 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  28.57 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  21.8 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  24.27 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  28.17 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  23.3 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  24.44 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  26.82 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  21.97 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  22.08 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  21.18 
 
 		 336 aa  62.4  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  25.63 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1965  DNA polymerase III, delta subunit  21.3 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  25.1 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  20.46 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  20.69 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  25.18 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  20.07 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  20.68 
 
 		 338 aa  57  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  24.19 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  22.33 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  26.81 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  23.13 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  19.56 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  26.71 
 
 		 323 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  24.85 
 
 		 328 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  27.46 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2001  DNA polymerase III, delta subunit  21.43 
 
 		 341 aa  50.8  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.152484  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  24.46 
 
 		 326 aa  50.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  25.62 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  22.55 
 
 		 374 aa  49.7  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2450  DNA polymerase III delta  30.35 
 
 		 458 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  25.23 
 
 		 332 aa  49.3  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2201  DNA polymerase III, delta subunit  20 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.638698 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1564  DNA polymerase III, delta subunit  20.88 
 
 		 340 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0402  DNA polymerase III, delta subunit  26.09 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.745977  normal  0.62254 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2834  DNA polymerase III, delta subunit  30.46 
 
 		 325 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.68901 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  23.2 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0179  DNA polymerase III, delta subunit  20.46 
 
 		 331 aa  47.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  23.12 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  22.62 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01876  DNA polymerase III subunit delta  30.21 
 
 		 342 aa  46.2  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.84431  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  25.83 
 
 		 329 aa  46.2  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  23.6 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  20.9 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  22.5 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3200  DNA polymerase III subunit delta  24.74 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1378  DNA polymerase III subunit delta  21.77 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1311  DNA polymerase III subunit delta  21.77 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13290  DNA polymerase III, delta subunit  24.91 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  25.68 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  23.22 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2150  DNA polymerase III, delta subunit  21.97 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0339  DNA polymerase III, delta subunit  24.51 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00729017 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  25.23 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  23.39 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  23.22 
 
 		 345 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2130  DNA polymerase III, delta subunit  22.67 
 
 		 358 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0903224 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2304  DNA polymerase III, delta subunit  22.46 
 
 		 357 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477598  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  23.22 
 
 		 345 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  23.22 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0260  DNA polymerase III, delta subunit  20.74 
 
 		 346 aa  43.9  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>