89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3469 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 		 329 aa  662    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  76.83 
 
 		 328 aa  494  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  58.77 
 
 		 328 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  52.92 
 
 		 327 aa  359  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  52.92 
 
 		 327 aa  359  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  52.92 
 
 		 324 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  55.96 
 
 		 332 aa  346  3e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0212  DNA polymerase III subunit delta  57.05 
 
 		 316 aa  343  2e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5512  DNA polymerase III, delta subunit  37.15 
 
 		 318 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.504789 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00831  DNA polymerase III subunit delta  37.69 
 
 		 336 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0072  DNA polymerase III subunit delta  36.86 
 
 		 321 aa  206  7e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21151  DNA polymerase III subunit delta  32.4 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1245  DNA polymerase III subunit delta  32.4 
 
 		 342 aa  189  7e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  36.86 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17731  DNA polymerase III subunit delta  34.06 
 
 		 335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18371  DNA polymerase III subunit delta  30.93 
 
 		 333 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.926744  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1739  DNA polymerase III subunit delta  30.72 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.353532  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0083  DNA polymerase III subunit delta  32.52 
 
 		 319 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18561  DNA polymerase III subunit delta  30.33 
 
 		 333 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.318986  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18371  DNA polymerase III subunit delta  28.53 
 
 		 333 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5666  DNA polymerase III, delta subunit  33.96 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  26.84 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  27.14 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  24.92 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  28.13 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  24.92 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  25.84 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  25.23 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  23.79 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  24.47 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  24.85 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  23.46 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  25.8 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  23.15 
 
 		 336 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  23.64 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  23.15 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  23.64 
 
 		 336 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  23.32 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  23.32 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  23.32 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  23.32 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  23.32 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  23.32 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  22.52 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  31.88 
 
 		 323 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  24.14 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  26.02 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  26.22 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  25.36 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  24.24 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1404  DNA polymerase III, delta subunit  30.09 
 
 		 389 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  20.36 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  34.92 
 
 		 374 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  24.91 
 
 		 343 aa  54.3  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  27.74 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  22.46 
 
 		 339 aa  53.9  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  28.3 
 
 		 306 aa  53.9  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  22.46 
 
 		 331 aa  53.9  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  22.88 
 
 		 341 aa  52.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  25.69 
 
 		 399 aa  52.8  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  22.05 
 
 		 344 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  23.29 
 
 		 344 aa  50.8  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  25.28 
 
 		 346 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  26.05 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  23.88 
 
 		 331 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  25.28 
 
 		 342 aa  49.7  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  25.16 
 
 		 330 aa  49.7  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  24.54 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  23.75 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  25.15 
 
 		 354 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  23.42 
 
 		 335 aa  46.6  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  25.83 
 
 		 328 aa  46.2  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  21.35 
 
 		 323 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  25.34 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4252  DNA polymerase III subunit delta  24.26 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.400931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4384  DNA polymerase III subunit delta  23.08 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  24.41 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  23.29 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0179  DNA polymerase III, delta subunit  24.53 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0811  DNA polymerase III, delta subunit  27.06 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.692629 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  25.54 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  24.2 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0868  DNA polymerase III delta  37.04 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  22.73 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  22.73 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  24.91 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  22.83 
 
 		 342 aa  43.5  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  23.48 
 
 		 338 aa  42.7  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  29.76 
 
 		 345 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>