70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13290 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_13290  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 334 aa  647    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  63.32 
 
 		 330 aa  416  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1739  DNA polymerase III, delta subunit  60.61 
 
 		 334 aa  353  2e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2208  DNA polymerase III, delta subunit  61.13 
 
 		 339 aa  340  2e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  54.6 
 
 		 317 aa  324  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  53.85 
 
 		 317 aa  319  3e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2228  DNA polymerase III, delta subunit  63.28 
 
 		 310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  53.72 
 
 		 343 aa  287  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  46.75 
 
 		 325 aa  261  8e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  46.47 
 
 		 319 aa  252  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12440  DNA polymerase III, delta subunit  44.78 
 
 		 339 aa  249  3e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203264  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  46.18 
 
 		 327 aa  242  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  43.04 
 
 		 317 aa  238  9e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  43.59 
 
 		 326 aa  232  8.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  44.81 
 
 		 329 aa  230  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17400  DNA polymerase III, delta subunit  45.68 
 
 		 328 aa  229  4e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  44.59 
 
 		 319 aa  225  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  42.81 
 
 		 326 aa  222  7e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  45.28 
 
 		 335 aa  222  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3846  DNA polymerase III, delta subunit  42.63 
 
 		 326 aa  219  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  46.55 
 
 		 320 aa  215  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1206  hypothetical protein  44.13 
 
 		 322 aa  209  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0823  DNA polymerase III, delta subunit  41.49 
 
 		 346 aa  192  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00704203  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  39.82 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1259  DNA polymerase III, delta subunit  42.95 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.098932 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2801  DNA polymerase III delta  40.07 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3913  hypothetical protein  39.35 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  35.26 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  31.73 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2664  hypothetical protein  38.31 
 
 		 319 aa  159  9e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3511  hypothetical protein  37.18 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3583  hypothetical protein  37.18 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal  0.0173863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3523  hypothetical protein  37.18 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.360312  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2104  DNA polymerase III, delta subunit  43.55 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12441  hypothetical protein  40 
 
 		 322 aa  150  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  37.18 
 
 		 330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3186  DNA polymerase III delta  39.08 
 
 		 324 aa  135  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0941  putative DNA polymerase III, delta subunit  28.53 
 
 		 348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  26.01 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  28.4 
 
 		 332 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  24.21 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  23.01 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  25.09 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  24.7 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  27.31 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  21.67 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  27.96 
 
 		 338 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  21.86 
 
 		 341 aa  57  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  23.44 
 
 		 332 aa  57  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  26.25 
 
 		 345 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  23.51 
 
 		 334 aa  50.4  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  23.95 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  26.07 
 
 		 344 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  26.25 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  20.42 
 
 		 344 aa  48.5  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  21.81 
 
 		 328 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  25.38 
 
 		 345 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  20.81 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0828  DNA polymerase III delta  15.91 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2157  DNA polymerase III, delta subunit  29.92 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  25.1 
 
 		 342 aa  47  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  25.47 
 
 		 328 aa  46.6  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  21.25 
 
 		 345 aa  46.2  0.0009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  24.61 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  19.22 
 
 		 338 aa  44.3  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  26.77 
 
 		 335 aa  43.5  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  26.74 
 
 		 324 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  22.84 
 
 		 330 aa  42.7  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01220  DNA polymerase III subunit delta  20.65 
 
 		 339 aa  42.7  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2277  DNA-directed DNA polymerase  26.62 
 
 		 344 aa  42.7  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>