90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0946 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 
331 aa  673    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  28.37 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  27.49 
 
 
323 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  27.82 
 
 
329 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  26.73 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  27.14 
 
 
315 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 
354 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  21.81 
 
 
342 aa  86.7  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  21.14 
 
 
419 aa  85.9  9e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  22.03 
 
 
331 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  23.78 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  25.45 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  31.35 
 
 
330 aa  82  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  22.51 
 
 
399 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  24.28 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  21.79 
 
 
378 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  23.4 
 
 
332 aa  77  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  22.57 
 
 
325 aa  75.9  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0212  DNA polymerase III subunit delta  27.78 
 
 
316 aa  72.8  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  21.77 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  21.48 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  22.73 
 
 
332 aa  69.7  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  26.95 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  24.23 
 
 
348 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  22.8 
 
 
336 aa  67  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  23.17 
 
 
336 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  23.17 
 
 
336 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  23.17 
 
 
336 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  23.17 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  23.17 
 
 
336 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  23.17 
 
 
336 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  23.17 
 
 
336 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  19.93 
 
 
325 aa  64.3  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  23.2 
 
 
328 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  24.88 
 
 
336 aa  63.2  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  22.87 
 
 
336 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  25.73 
 
 
344 aa  62.8  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00831  DNA polymerase III subunit delta  25.29 
 
 
336 aa  62.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  20.21 
 
 
330 aa  62  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  22.87 
 
 
336 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1185  DNA polymerase III, delta subunit  22.26 
 
 
337 aa  60.5  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  24.06 
 
 
328 aa  59.7  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  24.02 
 
 
323 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  23.17 
 
 
334 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  21.04 
 
 
336 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  24.79 
 
 
336 aa  57.4  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  23.44 
 
 
343 aa  56.6  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  21.32 
 
 
338 aa  57  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 
335 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  24.37 
 
 
306 aa  56.6  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  26.02 
 
 
329 aa  56.2  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  24.75 
 
 
374 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  26.25 
 
 
328 aa  55.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0811  DNA polymerase III, delta subunit  25.98 
 
 
387 aa  54.3  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.692629 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0179  DNA polymerase III, delta subunit  19.86 
 
 
331 aa  53.1  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  20.39 
 
 
317 aa  53.1  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1652  DNA polymerase III subunit delta  22.6 
 
 
343 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.884155 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  21.49 
 
 
348 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  21.52 
 
 
327 aa  50.4  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2524  DNA polymerase III, delta subunit  22.84 
 
 
311 aa  50.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  25.58 
 
 
324 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  21.07 
 
 
348 aa  49.7  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  30.19 
 
 
332 aa  49.7  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  20.13 
 
 
333 aa  49.3  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  23.66 
 
 
325 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0072  DNA polymerase III subunit delta  23.6 
 
 
321 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  22.17 
 
 
324 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  20.45 
 
 
334 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  24.58 
 
 
338 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  22.06 
 
 
339 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  20.52 
 
 
334 aa  48.5  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  22.51 
 
 
328 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1866  DNA polymerase III subunit delta  23.53 
 
 
343 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  20.42 
 
 
346 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  22.67 
 
 
323 aa  47  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1587  DNA polymerase III subunit delta  22.31 
 
 
343 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0083136 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1977  DNA polymerase III subunit delta  21.92 
 
 
388 aa  46.2  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.286095  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  21.3 
 
 
336 aa  46.2  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  23.08 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  24.7 
 
 
343 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  20.74 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  22.78 
 
 
342 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_004310  BR2057  DNA polymerase III subunit delta  21.61 
 
 
347 aa  45.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  20.25 
 
 
344 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  22.22 
 
 
323 aa  43.5  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  21.29 
 
 
338 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17731  DNA polymerase III subunit delta  24.86 
 
 
335 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3310  DNA polymerase III subunit delta  23.38 
 
 
348 aa  43.1  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3200  DNA polymerase III subunit delta  21.4 
 
 
343 aa  42.7  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5666  DNA polymerase III, delta subunit  25.15 
 
 
319 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>