72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_3538 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 
328 aa  664    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  76.83 
 
 
329 aa  521  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  54.15 
 
 
324 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  51.99 
 
 
327 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  51.99 
 
 
327 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  56.79 
 
 
328 aa  368  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0212  DNA polymerase III subunit delta  55.91 
 
 
316 aa  350  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  53.07 
 
 
332 aa  335  5e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00831  DNA polymerase III subunit delta  35.26 
 
 
336 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5512  DNA polymerase III, delta subunit  34.98 
 
 
318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.504789 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0072  DNA polymerase III subunit delta  34.82 
 
 
321 aa  196  5.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21151  DNA polymerase III subunit delta  30.53 
 
 
342 aa  185  9e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1245  DNA polymerase III subunit delta  30.53 
 
 
342 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  35.14 
 
 
321 aa  179  7e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17731  DNA polymerase III subunit delta  33.33 
 
 
335 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0083  DNA polymerase III subunit delta  34.06 
 
 
319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18371  DNA polymerase III subunit delta  30.33 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.926744  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18371  DNA polymerase III subunit delta  28.53 
 
 
333 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18561  DNA polymerase III subunit delta  29.73 
 
 
333 aa  159  6e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.318986  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1739  DNA polymerase III subunit delta  28.92 
 
 
333 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.353532  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5666  DNA polymerase III, delta subunit  34.69 
 
 
319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  25.91 
 
 
329 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  25.38 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  24.62 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  24.25 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  22.62 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  24.93 
 
 
336 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  28.32 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  28.9 
 
 
336 aa  67  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  28.32 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  28.32 
 
 
336 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  23.35 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  28.32 
 
 
336 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  28.32 
 
 
336 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  30.04 
 
 
306 aa  62.8  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  27.75 
 
 
336 aa  62.8  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  27.75 
 
 
336 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  26.16 
 
 
343 aa  62.8  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  27.75 
 
 
336 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  27.75 
 
 
336 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  27.75 
 
 
336 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  23.58 
 
 
331 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  25.45 
 
 
315 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  23.21 
 
 
338 aa  60.5  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  24.7 
 
 
338 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  25.47 
 
 
346 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  25.08 
 
 
344 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  26.42 
 
 
330 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  22.1 
 
 
337 aa  57  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  26.35 
 
 
350 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  23.72 
 
 
354 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  28.18 
 
 
323 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  24.39 
 
 
345 aa  51.6  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  31.75 
 
 
374 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  22.4 
 
 
341 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  25.09 
 
 
335 aa  50.8  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  23.79 
 
 
342 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  27.72 
 
 
332 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0179  DNA polymerase III, delta subunit  27.22 
 
 
331 aa  49.7  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  22.57 
 
 
331 aa  48.9  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  25.91 
 
 
337 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0868  DNA polymerase III delta  25 
 
 
327 aa  47.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  22.36 
 
 
348 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  24.38 
 
 
312 aa  47.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  22.22 
 
 
378 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  22.13 
 
 
344 aa  45.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1151  DNA polymerase III, delta  23.64 
 
 
316 aa  44.3  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0670  DNA polymerase III delta  25.49 
 
 
320 aa  43.9  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.840892  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  24.05 
 
 
326 aa  43.9  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  21.84 
 
 
341 aa  43.5  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  24.24 
 
 
335 aa  43.5  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2277  DNA-directed DNA polymerase  27.59 
 
 
344 aa  42.7  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>