88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2524 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2524  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 311 aa  610  1e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2387  DNA polymerase III subunit delta  68.09 
 
 		 312 aa  387  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.778182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  34.8 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  28.52 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  29.74 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  29.15 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  29.74 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  29.15 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  29.15 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  29.74 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  29.13 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  29.13 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  29.13 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  29.13 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  29.13 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  26.67 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  31.17 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  28.87 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  26.89 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  27.27 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  28.21 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  30.39 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  30.85 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  24.28 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  24.29 
 
 		 337 aa  57  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  31.82 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  30.74 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  23.56 
 
 		 338 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  26.16 
 
 		 354 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  23.87 
 
 		 331 aa  52.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  29.38 
 
 		 348 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  26.4 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  25.39 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  34.39 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2157  DNA polymerase III, delta subunit  28.5 
 
 		 338 aa  51.2  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  22.08 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  31.45 
 
 		 344 aa  50.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  23.98 
 
 		 342 aa  50.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  22.84 
 
 		 331 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  30.52 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  22.16 
 
 		 323 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  27.23 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  31.43 
 
 		 319 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  25.87 
 
 		 350 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0806  DNA polymerase III subunit delta  25.8 
 
 		 343 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0617  DNA polymerase III, delta subunit  27.74 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.733396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0457  DNA polymerase III, delta subunit  27.74 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  25.36 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  26.63 
 
 		 378 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  23.38 
 
 		 348 aa  47  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0699  DNA polymerase III delta  25.96 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000587672  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  23.38 
 
 		 348 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  27.72 
 
 		 333 aa  46.6  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2910  DNA polymerase III subunit delta  28.76 
 
 		 345 aa  46.2  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  30.66 
 
 		 343 aa  46.2  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0703  DNA polymerase III subunit delta  25.8 
 
 		 343 aa  45.8  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0770621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0762  DNA polymerase III subunit delta  25.8 
 
 		 343 aa  45.8  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0689  DNA polymerase III subunit delta  25.8 
 
 		 343 aa  45.8  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00596065  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0749  DNA polymerase III subunit delta  25.8 
 
 		 343 aa  45.8  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0941717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  27.98 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  33.33 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  33.88 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  33.33 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  25.32 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.8 
 
 		 562 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  30.06 
 
 		 345 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1819  DNA polymerase III subunit delta  27.42 
 
 		 334 aa  43.9  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0075815  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24 
 
 		 562 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0692  DNA polymerase III subunit delta  31.09 
 
 		 343 aa  43.9  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000216936  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00609  DNA polymerase III subunit delta  31.09 
 
 		 343 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0200544  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1742  DNA polymerase III, delta subunit  32.76 
 
 		 335 aa  43.5  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.260854  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2928  DNA polymerase III subunit delta  29.31 
 
 		 344 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0666  DNA polymerase III subunit delta  31.09 
 
 		 343 aa  43.5  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000205044  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00598  hypothetical protein  31.09 
 
 		 343 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0206116  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1844  DNA polymerase III subunit delta  29.31 
 
 		 344 aa  43.5  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3017  DNA polymerase III subunit delta  29.31 
 
 		 344 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0336067  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3005  DNA polymerase III subunit delta  31.09 
 
 		 343 aa  43.9  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00124747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0660  DNA polymerase III subunit delta  31.09 
 
 		 343 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000888397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0729  DNA polymerase III subunit delta  31.09 
 
 		 343 aa  43.9  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000331026  normal  0.281474 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1205  DNA polymerase III subunit delta  29.31 
 
 		 344 aa  43.5  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24 
 
 		 562 aa  43.5  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2986  DNA polymerase III, delta subunit  31.09 
 
 		 343 aa  43.5  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24 
 
 		 562 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1185  DNA polymerase III subunit delta  28.57 
 
 		 341 aa  43.1  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  28 
 
 		 332 aa  42.7  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3310  DNA polymerase III subunit delta  29.39 
 
 		 348 aa  42.7  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0216  DNA polymerase III subunit delta  29.94 
 
 		 363 aa  42.7  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.533896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24 
 
 		 562 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>