130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4260 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 323 aa  661    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  47.8 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  45.28 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  42.86 
 
 		 324 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  35.62 
 
 		 330 aa  149  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  32.35 
 
 		 334 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  31.53 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  28.71 
 
 		 331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  30.87 
 
 		 329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  31.43 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  26.92 
 
 		 399 aa  123  4e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  26.33 
 
 		 419 aa  123  4e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  26.92 
 
 		 337 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  27.58 
 
 		 346 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  27.14 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  28.95 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  24.84 
 
 		 325 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  25.54 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  33.59 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  26.37 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  27.04 
 
 		 334 aa  99.4  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  27.22 
 
 		 348 aa  99.4  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  30.34 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  26.38 
 
 		 378 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  26.3 
 
 		 323 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  27.15 
 
 		 331 aa  97.1  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  27.44 
 
 		 330 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  24.36 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  25.16 
 
 		 328 aa  93.6  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  25 
 
 		 336 aa  92.8  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  24.68 
 
 		 336 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  24.68 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  24.68 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  24.68 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  24.68 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  24.68 
 
 		 336 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  24.68 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  24.68 
 
 		 336 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  24.68 
 
 		 336 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  26.18 
 
 		 336 aa  87.8  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  23.31 
 
 		 339 aa  87.4  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  25.49 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  25.23 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  27.83 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  22.59 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  27.47 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  21.3 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  27.11 
 
 		 374 aa  79.3  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  30.15 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  24.35 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  25.48 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00831  DNA polymerase III subunit delta  26.52 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  32.75 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  22.26 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  25.16 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1739  DNA polymerase III subunit delta  22.76 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.353532  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1185  DNA polymerase III, delta subunit  24.1 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  22.39 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  26.21 
 
 		 339 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0212  DNA polymerase III subunit delta  25.94 
 
 		 316 aa  67  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  20.07 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  28.63 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2150  DNA polymerase III, delta subunit  24.35 
 
 		 348 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18561  DNA polymerase III subunit delta  23.29 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.318986  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17731  DNA polymerase III subunit delta  25.39 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  29.35 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  26.26 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  25.98 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  27.69 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18371  DNA polymerase III subunit delta  22.49 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.926744  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0083  DNA polymerase III subunit delta  24.03 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0072  DNA polymerase III subunit delta  25.59 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  23.66 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  22.47 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  20 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1965  DNA polymerase III, delta subunit  22.22 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18371  DNA polymerase III subunit delta  23.19 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  27.05 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  28.91 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  25.22 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1564  DNA polymerase III, delta subunit  24.02 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  23.64 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2201  DNA polymerase III, delta subunit  23.67 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.638698 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  22.08 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2834  DNA polymerase III, delta subunit  27.88 
 
 		 325 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.68901 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  24.41 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  26.52 
 
 		 317 aa  53.1  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2304  DNA polymerase III, delta subunit  22.94 
 
 		 357 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477598  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2450  DNA polymerase III delta  28.57 
 
 		 458 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0179  DNA polymerase III, delta subunit  19.47 
 
 		 331 aa  52  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1313  DNA polymerase III, delta  29.75 
 
 		 465 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2524  DNA polymerase III, delta subunit  25.39 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  21.47 
 
 		 338 aa  51.2  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  26.48 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  24.13 
 
 		 342 aa  50.8  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  23.32 
 
 		 337 aa  51.2  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21151  DNA polymerase III subunit delta  23.13 
 
 		 342 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0169  DNA polymerase III subunit delta  25.49 
 
 		 342 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2547  DNA polymerase III delta  29.75 
 
 		 465 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0981779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>