96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_0043 on replicon NC_011775
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 
323 aa  651    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  34.59 
 
 
344 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  30.82 
 
 
348 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  36.02 
 
 
336 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  35.4 
 
 
336 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  35.4 
 
 
336 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  34.78 
 
 
336 aa  185  7e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  35.4 
 
 
336 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  35.4 
 
 
336 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  35.4 
 
 
336 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  35.09 
 
 
336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  35.4 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  35.09 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  35.4 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  30.34 
 
 
343 aa  145  8.000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  30.53 
 
 
324 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  28.35 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  28.35 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  25.55 
 
 
329 aa  126  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  25.55 
 
 
329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  23.53 
 
 
334 aa  116  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  23.68 
 
 
354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 
315 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  24.1 
 
 
331 aa  113  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  28.06 
 
 
334 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  23.68 
 
 
335 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  21.91 
 
 
337 aa  102  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  24.45 
 
 
324 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  26.56 
 
 
330 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  23.97 
 
 
337 aa  98.6  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  22.81 
 
 
378 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  26.24 
 
 
306 aa  97.1  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  26.23 
 
 
333 aa  95.5  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  30.09 
 
 
323 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  24.04 
 
 
346 aa  93.6  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  23.53 
 
 
338 aa  93.2  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1819  DNA polymerase III subunit delta  27.49 
 
 
334 aa  92.8  7e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0075815  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  23.2 
 
 
330 aa  92  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  23.68 
 
 
336 aa  90.5  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  27.02 
 
 
331 aa  87.8  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  26.89 
 
 
344 aa  87  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  22.5 
 
 
336 aa  86.7  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  25.86 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  20.87 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  24.06 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 
342 aa  79  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  24.5 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1173  DNA polymerase III, delta subunit  26.47 
 
 
329 aa  76.6  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163613  hitchhiker  0.0000000248106 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  23.48 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  21.09 
 
 
332 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  23.24 
 
 
374 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  26.22 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  24.42 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  18.21 
 
 
338 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  23.27 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  22.67 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  26.56 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5512  DNA polymerase III, delta subunit  23.53 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.504789 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  22.95 
 
 
339 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  21.52 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  22.77 
 
 
323 aa  63.9  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  24.15 
 
 
334 aa  63.5  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  25.08 
 
 
344 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  22.64 
 
 
328 aa  60.8  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  25 
 
 
341 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  20 
 
 
339 aa  59.7  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  25.1 
 
 
328 aa  59.3  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  24.02 
 
 
331 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  24.92 
 
 
331 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  21.45 
 
 
348 aa  56.2  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  23.04 
 
 
312 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  24.44 
 
 
336 aa  55.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0179  DNA polymerase III, delta subunit  24.64 
 
 
331 aa  54.7  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  21.76 
 
 
399 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  22.09 
 
 
348 aa  53.9  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  20.66 
 
 
419 aa  52.8  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  22.12 
 
 
324 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  26.67 
 
 
328 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  23.4 
 
 
317 aa  50.4  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1188  DNA polymerase III delta  22.36 
 
 
481 aa  49.3  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2524  DNA polymerase III, delta subunit  22.16 
 
 
311 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2834  DNA polymerase III, delta subunit  24.66 
 
 
325 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.68901 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  22.31 
 
 
330 aa  47.4  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  21.22 
 
 
326 aa  46.6  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  25.41 
 
 
342 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  27.01 
 
 
345 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  21.35 
 
 
329 aa  45.8  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1245  DNA polymerase III subunit delta  22.46 
 
 
342 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  20.65 
 
 
335 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21151  DNA polymerase III subunit delta  23.47 
 
 
342 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  25.55 
 
 
345 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2387  DNA polymerase III subunit delta  23.68 
 
 
312 aa  43.9  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.778182  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  20.19 
 
 
319 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0670  DNA polymerase III delta  22.85 
 
 
320 aa  43.9  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.840892  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  26.13 
 
 
328 aa  43.1  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  21.12 
 
 
332 aa  43.1  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>