51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0332 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 		 323 aa  660    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0941  putative DNA polymerase III, delta subunit  55.36 
 
 		 348 aa  353  2e-96  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  37.07 
 
 		 325 aa  196  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1739  DNA polymerase III, delta subunit  36.74 
 
 		 334 aa  175  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  35.99 
 
 		 330 aa  172  5e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  34.29 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  34.27 
 
 		 327 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  33.76 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  32.69 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13290  DNA polymerase III, delta subunit  31.73 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  33.65 
 
 		 320 aa  149  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2208  DNA polymerase III, delta subunit  32.37 
 
 		 339 aa  149  8e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0823  DNA polymerase III, delta subunit  32.81 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00704203  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  33.33 
 
 		 335 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  30.7 
 
 		 343 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  33.23 
 
 		 326 aa  132  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  30.06 
 
 		 317 aa  132  7.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  32.48 
 
 		 326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1206  hypothetical protein  31.97 
 
 		 322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  29.45 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3846  DNA polymerase III, delta subunit  33.75 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  30.91 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  32.19 
 
 		 319 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17400  DNA polymerase III, delta subunit  30.06 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  30.35 
 
 		 330 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12440  DNA polymerase III, delta subunit  31.62 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203264  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  30.15 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2228  DNA polymerase III, delta subunit  32.91 
 
 		 310 aa  116  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2801  DNA polymerase III delta  28.92 
 
 		 301 aa  105  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3913  hypothetical protein  30.08 
 
 		 316 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3583  hypothetical protein  30.57 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal  0.0173863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3511  hypothetical protein  30.57 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3523  hypothetical protein  30.57 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.360312  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1259  DNA polymerase III, delta subunit  29.47 
 
 		 334 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.098932 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3186  DNA polymerase III delta  27.5 
 
 		 324 aa  95.9  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2104  DNA polymerase III, delta subunit  32.28 
 
 		 333 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2664  hypothetical protein  29.7 
 
 		 319 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12441  hypothetical protein  26.67 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  22.19 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  24.31 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  22.91 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  24.51 
 
 		 338 aa  52.4  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2524  DNA polymerase III, delta subunit  26.4 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  26.52 
 
 		 335 aa  49.7  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  25.97 
 
 		 336 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  27.87 
 
 		 312 aa  47.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2387  DNA polymerase III subunit delta  26.43 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.778182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  24.75 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0828  DNA polymerase III delta  20.63 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  22.22 
 
 		 331 aa  43.5  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  25.21 
 
 		 336 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>