60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3913 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3913  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  608  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2664  hypothetical protein  91.43 
 
 		 319 aa  547  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3523  hypothetical protein  85.94 
 
 		 320 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.360312  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3583  hypothetical protein  86.26 
 
 		 320 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal  0.0173863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3511  hypothetical protein  86.26 
 
 		 320 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12441  hypothetical protein  81.15 
 
 		 322 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2801  DNA polymerase III delta  62.54 
 
 		 301 aa  323  2e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3186  DNA polymerase III delta  58.84 
 
 		 324 aa  316  3e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1206  hypothetical protein  56.41 
 
 		 322 aa  305  8.000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  53.04 
 
 		 326 aa  302  5.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  50 
 
 		 329 aa  268  7e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  49.35 
 
 		 326 aa  259  6e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  48.72 
 
 		 319 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3846  DNA polymerase III, delta subunit  48.21 
 
 		 326 aa  250  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  45.86 
 
 		 319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  44.13 
 
 		 330 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  43.51 
 
 		 325 aa  228  9e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  45.45 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  44.09 
 
 		 335 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  43.31 
 
 		 320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0823  DNA polymerase III, delta subunit  46.41 
 
 		 346 aa  195  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00704203  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1259  DNA polymerase III, delta subunit  47.27 
 
 		 334 aa  192  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.098932 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  38.99 
 
 		 330 aa  183  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  38.73 
 
 		 317 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  36.77 
 
 		 317 aa  179  4.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1739  DNA polymerase III, delta subunit  40.84 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2208  DNA polymerase III, delta subunit  41.88 
 
 		 339 aa  172  6.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2104  DNA polymerase III, delta subunit  43.04 
 
 		 333 aa  169  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  39.94 
 
 		 342 aa  168  9e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2228  DNA polymerase III, delta subunit  41.37 
 
 		 310 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13290  DNA polymerase III, delta subunit  39.35 
 
 		 334 aa  162  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  35.05 
 
 		 317 aa  154  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  35.56 
 
 		 330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12440  DNA polymerase III, delta subunit  37.63 
 
 		 339 aa  143  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203264  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  35.96 
 
 		 343 aa  133  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  30.08 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17400  DNA polymerase III, delta subunit  31.01 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0941  putative DNA polymerase III, delta subunit  27.89 
 
 		 348 aa  93.2  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  24.62 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  26.93 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  24.34 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  23.78 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  25.44 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  24.26 
 
 		 336 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  24.26 
 
 		 336 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  24.4 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  24.26 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  24.4 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  24.4 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  24.4 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  24.4 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  24.4 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  24.26 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  25.45 
 
 		 337 aa  53.5  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  25.55 
 
 		 330 aa  49.7  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0462  DNA polymerase III, delta subunit superfamily protein  27.61 
 
 		 323 aa  47  0.0004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0321349  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  23.76 
 
 		 338 aa  47.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  25.75 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  27.92 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  21.15 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>