79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_17400 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_17400  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 328 aa  646    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  46.35 
 
 		 330 aa  258  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2208  DNA polymerase III, delta subunit  47.52 
 
 		 339 aa  248  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13290  DNA polymerase III, delta subunit  45.68 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  44.83 
 
 		 317 aa  241  9e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  44.55 
 
 		 317 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1739  DNA polymerase III, delta subunit  47.85 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  41.72 
 
 		 325 aa  225  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  42.46 
 
 		 343 aa  212  7e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  40.13 
 
 		 317 aa  207  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2228  DNA polymerase III, delta subunit  45.34 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  40.74 
 
 		 320 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  39.13 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  40.18 
 
 		 327 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  38.51 
 
 		 326 aa  187  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  42.46 
 
 		 335 aa  185  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12440  DNA polymerase III, delta subunit  38.77 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203264  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  37.69 
 
 		 319 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  37.04 
 
 		 326 aa  180  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3846  DNA polymerase III, delta subunit  37.65 
 
 		 326 aa  178  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0823  DNA polymerase III, delta subunit  41.05 
 
 		 346 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00704203  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  35.29 
 
 		 329 aa  165  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  37.04 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1206  hypothetical protein  36.05 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  35.24 
 
 		 330 aa  155  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1259  DNA polymerase III, delta subunit  38.39 
 
 		 334 aa  152  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.098932 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2801  DNA polymerase III delta  36.23 
 
 		 301 aa  145  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  30.06 
 
 		 323 aa  142  7e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2104  DNA polymerase III, delta subunit  41.03 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  36.39 
 
 		 342 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3523  hypothetical protein  31.11 
 
 		 320 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.360312  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3583  hypothetical protein  31.11 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal  0.0173863 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3913  hypothetical protein  30.77 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3511  hypothetical protein  31.11 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2664  hypothetical protein  30.45 
 
 		 319 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12441  hypothetical protein  29.17 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0941  putative DNA polymerase III, delta subunit  26.11 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3186  DNA polymerase III delta  32.21 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  24.38 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  27.05 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  22.87 
 
 		 331 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  25.97 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  27.24 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  22.45 
 
 		 378 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  25 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  23.6 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  28.39 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  30.18 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  23.08 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  26.35 
 
 		 338 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  22.39 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0481  DNA polymerase III subunit delta  26.33 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0072  DNA polymerase III subunit delta  29.55 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  19.34 
 
 		 338 aa  53.5  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  25.9 
 
 		 330 aa  53.5  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  20.37 
 
 		 328 aa  53.1  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  25.08 
 
 		 328 aa  52.8  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2496  DNA polymerase III, delta  27.68 
 
 		 330 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  22.38 
 
 		 332 aa  50.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0838  DNA polymerase III, delta subunit  27.68 
 
 		 330 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  21.85 
 
 		 334 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  24.11 
 
 		 327 aa  47  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00831  DNA polymerase III subunit delta  25.58 
 
 		 336 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  26.96 
 
 		 344 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  27.59 
 
 		 321 aa  46.6  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  25.52 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2767  DNA polymerase III, delta subunit  25.49 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0216  DNA polymerase III subunit delta  25.79 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.533896  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  18.54 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  21.82 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1866  DNA polymerase III subunit delta  26.56 
 
 		 343 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  26.39 
 
 		 345 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  23.01 
 
 		 336 aa  43.5  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  26.39 
 
 		 345 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  24.85 
 
 		 345 aa  43.5  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  26.55 
 
 		 344 aa  43.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  25.69 
 
 		 351 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  24.4 
 
 		 351 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1587  DNA polymerase III subunit delta  26.56 
 
 		 343 aa  43.1  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0083136 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>