91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0823 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0823  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 346 aa  677    Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00704203  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  79.3 
 
 		 320 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  60.32 
 
 		 319 aa  365  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  56.83 
 
 		 325 aa  352  5e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  56.57 
 
 		 327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  58.57 
 
 		 335 aa  320  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  50.15 
 
 		 326 aa  295  6e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  49.84 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3846  DNA polymerase III, delta subunit  48.76 
 
 		 326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  47.53 
 
 		 329 aa  281  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  46.23 
 
 		 319 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1206  hypothetical protein  48.89 
 
 		 322 aa  256  5e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  45.98 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  45.13 
 
 		 342 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  41.05 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3913  hypothetical protein  46.41 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3523  hypothetical protein  46.15 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.360312  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3583  hypothetical protein  46.15 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal  0.0173863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1259  DNA polymerase III, delta subunit  46.44 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.098932 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3511  hypothetical protein  46.15 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1739  DNA polymerase III, delta subunit  41.84 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13290  DNA polymerase III, delta subunit  41.49 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  42.54 
 
 		 330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2664  hypothetical protein  46.3 
 
 		 319 aa  218  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12441  hypothetical protein  47.02 
 
 		 322 aa  216  7e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2104  DNA polymerase III, delta subunit  50.32 
 
 		 333 aa  210  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  40.38 
 
 		 317 aa  206  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  39.12 
 
 		 317 aa  203  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  39.75 
 
 		 317 aa  199  5e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2801  DNA polymerase III delta  41.45 
 
 		 301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  37.54 
 
 		 343 aa  194  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2208  DNA polymerase III, delta subunit  38.6 
 
 		 339 aa  192  9e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17400  DNA polymerase III, delta subunit  41.05 
 
 		 328 aa  186  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12440  DNA polymerase III, delta subunit  36.44 
 
 		 339 aa  186  4e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203264  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2228  DNA polymerase III, delta subunit  42.44 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3186  DNA polymerase III delta  38.99 
 
 		 324 aa  183  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  32.81 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0941  putative DNA polymerase III, delta subunit  28.65 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  27.69 
 
 		 329 aa  90.1  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  28.31 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  23.78 
 
 		 331 aa  87  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  23.48 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  24.77 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  22.09 
 
 		 332 aa  67  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  26.48 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  22.67 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  26.17 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  23.91 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  25.93 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  21.92 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 		 330 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  23.82 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  23.85 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  25.1 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  19.57 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  25.53 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  28.73 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  21.66 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  22.73 
 
 		 334 aa  55.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  24.39 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  27.25 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1451  DNA polymerase III subunit delta  24.67 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0184698  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  23.7 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  22.75 
 
 		 344 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  24.56 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0828  DNA polymerase III delta  17.94 
 
 		 323 aa  50.8  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  20.81 
 
 		 332 aa  50.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  20.62 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  20.13 
 
 		 325 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  20.62 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  19.51 
 
 		 344 aa  47.8  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  20.62 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  20.62 
 
 		 336 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  20.62 
 
 		 336 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  25.72 
 
 		 312 aa  46.6  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  20.62 
 
 		 336 aa  46.2  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  20.62 
 
 		 336 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  20.62 
 
 		 336 aa  46.2  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  20.62 
 
 		 336 aa  46.2  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  20.62 
 
 		 336 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  21.34 
 
 		 344 aa  46.2  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  18.33 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  22.36 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  22.67 
 
 		 334 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  26.62 
 
 		 336 aa  44.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  21.59 
 
 		 337 aa  44.3  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  25.71 
 
 		 324 aa  43.9  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  24.77 
 
 		 354 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18561  DNA polymerase III subunit delta  20.65 
 
 		 333 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.318986  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18371  DNA polymerase III subunit delta  19.9 
 
 		 333 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.926744  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  27.23 
 
 		 323 aa  42.7  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>