95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2278 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  100 
 
 		 327 aa  639    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  71.56 
 
 		 325 aa  476  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  67.09 
 
 		 319 aa  403  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  59.75 
 
 		 335 aa  317  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  54.37 
 
 		 320 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0823  DNA polymerase III, delta subunit  56.57 
 
 		 346 aa  300  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00704203  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  51.58 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3846  DNA polymerase III, delta subunit  50.48 
 
 		 326 aa  281  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  49.68 
 
 		 319 aa  277  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  47.84 
 
 		 326 aa  273  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  48.26 
 
 		 330 aa  273  3e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  46.71 
 
 		 329 aa  265  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13290  DNA polymerase III, delta subunit  46.18 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  43.4 
 
 		 317 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  45.28 
 
 		 317 aa  242  5e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1739  DNA polymerase III, delta subunit  47.77 
 
 		 334 aa  241  9e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1206  hypothetical protein  47.95 
 
 		 322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  46.63 
 
 		 342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  46.06 
 
 		 343 aa  232  5e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1259  DNA polymerase III, delta subunit  48.15 
 
 		 334 aa  232  6e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.098932 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  43.49 
 
 		 330 aa  232  7.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3913  hypothetical protein  45.45 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2664  hypothetical protein  45.4 
 
 		 319 aa  226  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2104  DNA polymerase III, delta subunit  50.97 
 
 		 333 aa  225  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  42.68 
 
 		 330 aa  223  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2208  DNA polymerase III, delta subunit  44.16 
 
 		 339 aa  217  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3523  hypothetical protein  44.66 
 
 		 320 aa  215  8e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.360312  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3583  hypothetical protein  44.66 
 
 		 320 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal  0.0173863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3511  hypothetical protein  44.66 
 
 		 320 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2801  DNA polymerase III delta  41.79 
 
 		 301 aa  197  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12441  hypothetical protein  41.27 
 
 		 322 aa  196  7e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2228  DNA polymerase III, delta subunit  46.25 
 
 		 310 aa  195  8.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  36.77 
 
 		 317 aa  193  4e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17400  DNA polymerase III, delta subunit  40.18 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  34.27 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12440  DNA polymerase III, delta subunit  37.62 
 
 		 339 aa  172  6.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203264  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3186  DNA polymerase III delta  39.62 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0941  putative DNA polymerase III, delta subunit  32.74 
 
 		 348 aa  149  5e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  23.6 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  26.33 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  26.73 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  26.98 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  26.1 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  28.67 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  26.71 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  23.33 
 
 		 378 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  26.62 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  24.38 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  24.26 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  24.06 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  25.08 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  25.72 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  24.62 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  26.3 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  21.25 
 
 		 336 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  21.34 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  19.38 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  21.25 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  21.18 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  21.18 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  21.18 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  21.18 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  21.18 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  21.18 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  21.18 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  23.49 
 
 		 343 aa  53.9  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  26.85 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  22.36 
 
 		 336 aa  53.9  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  29.15 
 
 		 336 aa  53.5  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  26.09 
 
 		 327 aa  53.1  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  27.27 
 
 		 351 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  26.95 
 
 		 345 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  20.74 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  26.95 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  20.25 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  23.66 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  26.72 
 
 		 345 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  25.2 
 
 		 344 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3310  DNA polymerase III subunit delta  27.56 
 
 		 348 aa  47  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  26.3 
 
 		 342 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  26.05 
 
 		 351 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  22.94 
 
 		 334 aa  47  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0828  DNA polymerase III delta  18.37 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  19.23 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  24.04 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  16.82 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  16.82 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  23.9 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0481  DNA polymerase III subunit delta  25.95 
 
 		 362 aa  43.5  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  20.87 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  23.6 
 
 		 328 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01876  DNA polymerase III subunit delta  26.18 
 
 		 342 aa  43.1  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.84431  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2971  DNA polymerase III subunit delta  27.22 
 
 		 356 aa  42.7  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  24.79 
 
 		 333 aa  42.4  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>