47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3186 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3186  DNA polymerase III delta  100 
 
 		 324 aa  640    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3913  hypothetical protein  58.84 
 
 		 316 aa  335  5e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2664  hypothetical protein  58.68 
 
 		 319 aa  323  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3523  hypothetical protein  58.52 
 
 		 320 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.360312  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2801  DNA polymerase III delta  61.57 
 
 		 301 aa  320  1.9999999999999998e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3511  hypothetical protein  58.52 
 
 		 320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3583  hypothetical protein  58.52 
 
 		 320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal  0.0173863 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12441  hypothetical protein  55.52 
 
 		 322 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1206  hypothetical protein  50.31 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  47.13 
 
 		 326 aa  265  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  44.48 
 
 		 329 aa  228  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  41.77 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  40.12 
 
 		 330 aa  212  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3846  DNA polymerase III, delta subunit  41.77 
 
 		 326 aa  210  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  41.01 
 
 		 319 aa  208  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  41.41 
 
 		 319 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  40.45 
 
 		 325 aa  205  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  43.46 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  37.74 
 
 		 320 aa  182  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0823  DNA polymerase III, delta subunit  40.79 
 
 		 346 aa  177  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00704203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  39.62 
 
 		 327 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  35.91 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1259  DNA polymerase III, delta subunit  37.74 
 
 		 334 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.098932 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  34.7 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  35.53 
 
 		 330 aa  149  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  36.54 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12440  DNA polymerase III, delta subunit  36.76 
 
 		 339 aa  147  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203264  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  35.02 
 
 		 330 aa  146  5e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1739  DNA polymerase III, delta subunit  37.82 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  36.31 
 
 		 342 aa  143  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13290  DNA polymerase III, delta subunit  39.16 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2228  DNA polymerase III, delta subunit  38.44 
 
 		 310 aa  134  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2104  DNA polymerase III, delta subunit  35.83 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  32.37 
 
 		 343 aa  126  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2208  DNA polymerase III, delta subunit  38.58 
 
 		 339 aa  122  9e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  27.83 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0941  putative DNA polymerase III, delta subunit  26.61 
 
 		 348 aa  96.7  5e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17400  DNA polymerase III, delta subunit  32.49 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  23.27 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  21.2 
 
 		 339 aa  49.7  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  26.55 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  23.62 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  26.02 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  27.84 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  22.75 
 
 		 328 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  22.97 
 
 		 334 aa  42.7  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0072  DNA polymerase III subunit delta  25.67 
 
 		 321 aa  42.7  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>