72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2208 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2208  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 339 aa  654    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13290  DNA polymerase III, delta subunit  61.13 
 
 		 334 aa  347  2e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1739  DNA polymerase III, delta subunit  58.99 
 
 		 334 aa  332  5e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  52.04 
 
 		 330 aa  325  7e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  53.21 
 
 		 317 aa  319  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  50.96 
 
 		 317 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2228  DNA polymerase III, delta subunit  58.71 
 
 		 310 aa  278  7e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  47.47 
 
 		 343 aa  239  5.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  46.1 
 
 		 319 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  44.05 
 
 		 317 aa  236  5.0000000000000005e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17400  DNA polymerase III, delta subunit  47.52 
 
 		 328 aa  235  7e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  44.16 
 
 		 325 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  43.22 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12440  DNA polymerase III, delta subunit  42.86 
 
 		 339 aa  216  5e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203264  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  42.77 
 
 		 326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  44.16 
 
 		 327 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3846  DNA polymerase III, delta subunit  42.77 
 
 		 326 aa  205  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  42.9 
 
 		 326 aa  202  7e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1206  hypothetical protein  42.45 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  42.36 
 
 		 335 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3913  hypothetical protein  41.88 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  38.68 
 
 		 329 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3583  hypothetical protein  40.91 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal  0.0173863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3523  hypothetical protein  40.91 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.360312  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3511  hypothetical protein  40.91 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  36.63 
 
 		 330 aa  179  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  37.9 
 
 		 320 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0823  DNA polymerase III, delta subunit  38.6 
 
 		 346 aa  176  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00704203  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2664  hypothetical protein  39.81 
 
 		 319 aa  173  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1259  DNA polymerase III, delta subunit  40.97 
 
 		 334 aa  169  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.098932 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  39.24 
 
 		 342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  32.37 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2801  DNA polymerase III delta  39.85 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2104  DNA polymerase III, delta subunit  44.23 
 
 		 333 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12441  hypothetical protein  37.54 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  37.94 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0941  putative DNA polymerase III, delta subunit  30.12 
 
 		 348 aa  142  9e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3186  DNA polymerase III delta  38.58 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  25.07 
 
 		 346 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  24.52 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  26.48 
 
 		 344 aa  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  25.08 
 
 		 344 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  21.36 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  22.69 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  25.08 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  28.92 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  26.12 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  26.95 
 
 		 321 aa  53.5  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  23.93 
 
 		 345 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  23.3 
 
 		 329 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  23.55 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  24.59 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3310  DNA polymerase III subunit delta  25.07 
 
 		 348 aa  50.4  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2157  DNA polymerase III, delta subunit  33.59 
 
 		 338 aa  50.8  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  22.37 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  25.65 
 
 		 312 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  24.32 
 
 		 350 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  17.83 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  22.64 
 
 		 323 aa  47.4  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  28.57 
 
 		 324 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  26.82 
 
 		 342 aa  47  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  24.26 
 
 		 345 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  28.38 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2850  DNA polymerase III, delta subunit  28.77 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal  0.104898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  24.44 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  21.47 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  17.59 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0072  DNA polymerase III subunit delta  26.07 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  23.98 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  24.84 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  24.3 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  20.24 
 
 		 328 aa  43.5  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>