110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0745 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 312 aa  609  1e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2524  DNA polymerase III, delta subunit  36.25 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2387  DNA polymerase III subunit delta  36.42 
 
 		 312 aa  136  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.778182  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  29.95 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  29.53 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  29.95 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  29.53 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  29.53 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  29.95 
 
 		 336 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  29.95 
 
 		 336 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  29.95 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  29.95 
 
 		 336 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  29.02 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  29.95 
 
 		 336 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  25.74 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  32.94 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  32.34 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  25.29 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  31.68 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  23.28 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  23.28 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  28.57 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  27.75 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  28.35 
 
 		 419 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  28.89 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  26.8 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  31.49 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  26.94 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  32.84 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  22.22 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  27.93 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  28.49 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  25.55 
 
 		 337 aa  57  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  26.17 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1819  DNA polymerase III subunit delta  29.79 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0075815  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  27.84 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  23.04 
 
 		 323 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  27.64 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  23.15 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  22.51 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1311  DNA polymerase III subunit delta  25.72 
 
 		 343 aa  54.7  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  28.26 
 
 		 328 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  27.91 
 
 		 332 aa  54.3  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  22.47 
 
 		 328 aa  54.3  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  25 
 
 		 336 aa  53.5  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  27.37 
 
 		 344 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1378  DNA polymerase III subunit delta  25.72 
 
 		 343 aa  53.5  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  27.89 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  27.72 
 
 		 330 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  23.98 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  24.6 
 
 		 325 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  23.39 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  28.1 
 
 		 324 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  24.91 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  29.5 
 
 		 336 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0212  DNA polymerase III subunit delta  24.23 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  27.95 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3511  hypothetical protein  27.34 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3583  hypothetical protein  27.34 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal  0.0173863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3523  hypothetical protein  27.34 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.360312  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  26.67 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  26.86 
 
 		 341 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  26.67 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  27.53 
 
 		 378 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0828  DNA polymerase III delta  21.95 
 
 		 323 aa  50.1  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  30.19 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3913  hypothetical protein  26.02 
 
 		 316 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0072  DNA polymerase III subunit delta  26.87 
 
 		 321 aa  49.7  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  24.37 
 
 		 317 aa  49.3  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2664  hypothetical protein  26.98 
 
 		 319 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  24.34 
 
 		 334 aa  49.3  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  28.41 
 
 		 337 aa  49.3  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  26.9 
 
 		 343 aa  49.3  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  26.69 
 
 		 374 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1189  DNA polymerase III, delta subunit  24.75 
 
 		 331 aa  48.5  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.725755  normal  0.332691 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  25 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0743  DNA polymerase III, delta subunit  30 
 
 		 324 aa  47.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  27.6 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0767  DNA polymerase III, delta subunit  30 
 
 		 324 aa  47.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  27.87 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  27.72 
 
 		 333 aa  46.6  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2547  DNA polymerase III delta  28.5 
 
 		 465 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0981779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2643  DNA polymerase III delta  28.5 
 
 		 465 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.640938  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  25.49 
 
 		 344 aa  45.8  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  23.15 
 
 		 338 aa  46.2  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1313  DNA polymerase III, delta  28.5 
 
 		 465 aa  45.8  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  26.67 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2157  DNA polymerase III, delta subunit  27.45 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  26.77 
 
 		 342 aa  45.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1587  DNA polymerase III subunit delta  28.33 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0083136 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0699  DNA polymerase III delta  23.15 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000587672  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01220  DNA polymerase III subunit delta  28.57 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2960  DNA polymerase III subunit delta  28.57 
 
 		 343 aa  44.3  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  26.98 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  24.54 
 
 		 328 aa  43.9  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01876  DNA polymerase III subunit delta  28.93 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.84431  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  21.83 
 
 		 336 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1866  DNA polymerase III subunit delta  29.7 
 
 		 343 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2277  DNA-directed DNA polymerase  36.36 
 
 		 344 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1564  DNA polymerase III, delta subunit  27.48 
 
 		 340 aa  43.5  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>