61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_12440 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_12440  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 339 aa  668    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203264  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  49.36 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  49.53 
 
 		 317 aa  284  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  44.12 
 
 		 330 aa  247  3e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13290  DNA polymerase III, delta subunit  44.48 
 
 		 334 aa  239  4e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1739  DNA polymerase III, delta subunit  46.58 
 
 		 334 aa  239  6.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  44.66 
 
 		 343 aa  225  8e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2228  DNA polymerase III, delta subunit  48.24 
 
 		 310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  42.48 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2208  DNA polymerase III, delta subunit  42.86 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  39.62 
 
 		 319 aa  189  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  39.1 
 
 		 319 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  38.66 
 
 		 325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  40.35 
 
 		 320 aa  182  8.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  41.05 
 
 		 335 aa  182  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2801  DNA polymerase III delta  39.02 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  40.63 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  38.12 
 
 		 326 aa  169  6e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  38.24 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17400  DNA polymerase III, delta subunit  38.77 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0823  DNA polymerase III, delta subunit  39.02 
 
 		 346 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00704203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  37.3 
 
 		 327 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3523  hypothetical protein  35.65 
 
 		 320 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.360312  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3511  hypothetical protein  35.65 
 
 		 320 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3583  hypothetical protein  35.65 
 
 		 320 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal  0.0173863 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1206  hypothetical protein  40.21 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3913  hypothetical protein  37.46 
 
 		 316 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3846  DNA polymerase III, delta subunit  38.85 
 
 		 326 aa  153  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  37.74 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  34.81 
 
 		 330 aa  149  9e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2664  hypothetical protein  36.16 
 
 		 319 aa  145  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  37.26 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3186  DNA polymerase III delta  35.85 
 
 		 324 aa  142  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12441  hypothetical protein  32.6 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  31.83 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1259  DNA polymerase III, delta subunit  34.5 
 
 		 334 aa  123  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.098932 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0941  putative DNA polymerase III, delta subunit  28.36 
 
 		 348 aa  122  7e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2104  DNA polymerase III, delta subunit  33.55 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  26.26 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  23.6 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  27.06 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  21.92 
 
 		 331 aa  57  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0729  hypothetical protein  22.4 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0375317  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  27.86 
 
 		 344 aa  54.7  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  22.63 
 
 		 328 aa  53.5  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  20.39 
 
 		 333 aa  50.8  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  29.11 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  21.88 
 
 		 344 aa  50.4  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3310  DNA polymerase III subunit delta  25.94 
 
 		 348 aa  50.1  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  21.65 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  23.22 
 
 		 330 aa  46.6  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2277  DNA-directed DNA polymerase  28.92 
 
 		 344 aa  46.2  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004219  DNA polymerase III delta subunit  26.11 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00302346  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  25.86 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01220  DNA polymerase III subunit delta  26.42 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1564  DNA polymerase III, delta subunit  24.26 
 
 		 340 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  25.35 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  20.9 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  25.13 
 
 		 344 aa  43.5  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  23.81 
 
 		 323 aa  43.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  20.14 
 
 		 331 aa  42.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>