186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1415 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 330 aa  662    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  42.51 
 
 		 337 aa  279  6e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  41.1 
 
 		 334 aa  273  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  37.58 
 
 		 331 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  38.46 
 
 		 329 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  38.46 
 
 		 329 aa  248  9e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  40.43 
 
 		 338 aa  246  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  36.47 
 
 		 336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  30.91 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  29.25 
 
 		 350 aa  146  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  30.79 
 
 		 338 aa  142  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  30.61 
 
 		 335 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  29.78 
 
 		 330 aa  132  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  26.46 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  25.52 
 
 		 344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  26.71 
 
 		 331 aa  129  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  28.49 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  27.89 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  26.93 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  24.62 
 
 		 341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  27.53 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  25.6 
 
 		 336 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  25.6 
 
 		 336 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  26.52 
 
 		 332 aa  119  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  23.55 
 
 		 344 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  25.15 
 
 		 348 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  23.84 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  25 
 
 		 336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  25.6 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  25.6 
 
 		 336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  25.6 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  25.6 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  25.6 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  25.6 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  26.5 
 
 		 324 aa  115  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  26.5 
 
 		 324 aa  115  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  25.6 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  25 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  28.21 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  26.19 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  25.96 
 
 		 336 aa  109  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  24.29 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  24.7 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  25.29 
 
 		 374 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  24.76 
 
 		 334 aa  106  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  24.55 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  22.75 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  24.46 
 
 		 325 aa  102  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  24.55 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  23.12 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  23.53 
 
 		 341 aa  99.4  7e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  26.45 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  22.32 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  24.19 
 
 		 346 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  28.32 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  25.15 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  24.62 
 
 		 346 aa  93.6  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  25.87 
 
 		 343 aa  93.2  6e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  24.53 
 
 		 327 aa  90.1  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0260  DNA polymerase III, delta subunit  27.25 
 
 		 346 aa  89  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  25.94 
 
 		 306 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  26.28 
 
 		 315 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  24.4 
 
 		 324 aa  87.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2150  DNA polymerase III, delta subunit  26.59 
 
 		 348 aa  87  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  25.61 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  26.69 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2201  DNA polymerase III, delta subunit  24.62 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.638698 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0224  DNA polymerase III, delta subunit  25.08 
 
 		 346 aa  82.8  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  23.74 
 
 		 399 aa  82.4  0.000000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  23.82 
 
 		 328 aa  82.4  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  22.76 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2577  DNA polymerase III, delta subunit  24.39 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1188  DNA polymerase III delta  27.59 
 
 		 481 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  24.63 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  24.42 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  24.55 
 
 		 327 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  24.55 
 
 		 327 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  22.44 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1965  DNA polymerase III, delta subunit  25.6 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  27.2 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  25.23 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  23.93 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  26.82 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  26.22 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  27.65 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2917  DNA polymerase III, delta subunit  27.55 
 
 		 342 aa  72.4  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  24.14 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1819  DNA polymerase III subunit delta  22.75 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0075815  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  24.29 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  24.14 
 
 		 345 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0481  DNA polymerase III, delta subunit  24.08 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  23.75 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  20.91 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  23.75 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2304  DNA polymerase III, delta subunit  23.81 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477598  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  19.51 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  26.15 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  22.57 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  27.75 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>