57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1188 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1188  DNA polymerase III delta  100 
 
 		 481 aa  974    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2450  DNA polymerase III delta  26.89 
 
 		 458 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1313  DNA polymerase III, delta  28.11 
 
 		 465 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2643  DNA polymerase III delta  27.6 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.640938  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2547  DNA polymerase III delta  27.81 
 
 		 465 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0981779  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  32.99 
 
 		 329 aa  99  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  33.85 
 
 		 334 aa  97.1  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  33.33 
 
 		 337 aa  94  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  32.99 
 
 		 329 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  31.28 
 
 		 331 aa  91.3  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  33.33 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  31.02 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  27.54 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  28.21 
 
 		 339 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  31.28 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  25.52 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  27.55 
 
 		 336 aa  65.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  29.61 
 
 		 335 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  27.31 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  26.59 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  29.83 
 
 		 374 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  29.46 
 
 		 324 aa  56.6  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  29.63 
 
 		 330 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  30.81 
 
 		 334 aa  55.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  27.88 
 
 		 336 aa  53.5  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  27.95 
 
 		 336 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  27.88 
 
 		 336 aa  53.5  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  27.95 
 
 		 336 aa  53.1  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  27.88 
 
 		 336 aa  53.5  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  27.95 
 
 		 336 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  27.88 
 
 		 336 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  27.05 
 
 		 324 aa  53.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  27.88 
 
 		 336 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  27.05 
 
 		 324 aa  53.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  28.66 
 
 		 344 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  23.41 
 
 		 350 aa  52  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  28.14 
 
 		 354 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  27.33 
 
 		 336 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  27.33 
 
 		 336 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  26.46 
 
 		 332 aa  50.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  21.61 
 
 		 327 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  21.61 
 
 		 327 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  26.32 
 
 		 342 aa  50.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  22.36 
 
 		 323 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0179  DNA polymerase III, delta subunit  23.97 
 
 		 331 aa  49.3  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  27.94 
 
 		 336 aa  49.7  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  22.55 
 
 		 348 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0811  DNA polymerase III, delta subunit  24.24 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.692629 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  30.77 
 
 		 341 aa  47  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  25.93 
 
 		 324 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  24.6 
 
 		 348 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  25.81 
 
 		 331 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  26.45 
 
 		 346 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  26.81 
 
 		 334 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  23.99 
 
 		 338 aa  45.1  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  25.41 
 
 		 344 aa  43.9  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  25.93 
 
 		 324 aa  43.5  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>