229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0203 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 334 aa  677    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  29.39 
 
 		 332 aa  129  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  26.43 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  27.81 
 
 		 334 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  26.22 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  25.23 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  25.4 
 
 		 348 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  25.23 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  24.22 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  26.28 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  25.87 
 
 		 336 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  24.02 
 
 		 336 aa  99.4  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  29.35 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  27.39 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  23.12 
 
 		 336 aa  97.1  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  27.44 
 
 		 325 aa  97.1  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  26.35 
 
 		 338 aa  96.7  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  26.47 
 
 		 341 aa  96.3  6e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  30.73 
 
 		 344 aa  96.3  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  23.12 
 
 		 336 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  29.48 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  22.82 
 
 		 336 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  22.82 
 
 		 336 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  22.82 
 
 		 336 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  22.82 
 
 		 336 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  23.12 
 
 		 336 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  23.12 
 
 		 336 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  23.12 
 
 		 336 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  30.33 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  22.82 
 
 		 336 aa  94.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  27.47 
 
 		 346 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  28.45 
 
 		 344 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  24.69 
 
 		 324 aa  90.5  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  24.69 
 
 		 324 aa  90.5  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  22.62 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  27.4 
 
 		 334 aa  87  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  24.55 
 
 		 330 aa  86.7  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  27.43 
 
 		 339 aa  85.9  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  27.18 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0260  DNA polymerase III, delta subunit  27.65 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  24.75 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  24.84 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  23.42 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  24.93 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  26.27 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2150  DNA polymerase III, delta subunit  30.43 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  24.84 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  27.43 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2201  DNA polymerase III, delta subunit  28.88 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.638698 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  22.91 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  26.05 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  24.78 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0224  DNA polymerase III, delta subunit  26.25 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2577  DNA polymerase III, delta subunit  29.79 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  24.09 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  24.86 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2304  DNA polymerase III, delta subunit  29.49 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477598  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1965  DNA polymerase III, delta subunit  23.71 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025089  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4814  DNA polymerase III, delta subunit  26.79 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.664461  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3310  DNA polymerase III subunit delta  25.29 
 
 		 348 aa  75.9  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  25.75 
 
 		 345 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  23.84 
 
 		 354 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  23.72 
 
 		 338 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4354  DNA polymerase III subunit delta  25.15 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2143  DNA polymerase III, delta subunit  22.8 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  22.77 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1451  DNA polymerase III subunit delta  24.02 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0184698  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  26.32 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  24.62 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  24.62 
 
 		 419 aa  72.8  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  22.77 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2277  DNA-directed DNA polymerase  25.91 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  21.33 
 
 		 374 aa  72.4  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1564  DNA polymerase III, delta subunit  24.77 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  23.1 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  26.67 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  31.32 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  23.85 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  23.85 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  26.21 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  26.84 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  25.48 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  23.78 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  24.7 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  25.64 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  23.44 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  25.64 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2157  DNA polymerase III, delta subunit  23.17 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  22.9 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  24.36 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  25.7 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0743  DNA polymerase III, delta subunit  26.8 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0767  DNA polymerase III, delta subunit  26.8 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  26.98 
 
 		 306 aa  67  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0639  DNA polymerase III subunit delta  25.71 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.858672 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0481  DNA polymerase III, delta subunit  27 
 
 		 338 aa  65.9  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  23.77 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  24.15 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  23.7 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>