229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_12890 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 337 aa  676    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  33.12 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  29.6 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  31.75 
 
 		 329 aa  159  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  31.52 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  32.06 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  30.7 
 
 		 337 aa  153  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  32.9 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  27.74 
 
 		 344 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  28.52 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  29.15 
 
 		 378 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  27.22 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  28.9 
 
 		 335 aa  135  8e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  27.99 
 
 		 346 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  25.99 
 
 		 336 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  25.69 
 
 		 336 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  25.69 
 
 		 336 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  25.69 
 
 		 336 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  25.69 
 
 		 336 aa  132  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  25.38 
 
 		 336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  25.61 
 
 		 348 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  25.38 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  25.38 
 
 		 336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  25.38 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  27.78 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  25.46 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  31.16 
 
 		 334 aa  129  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  27.76 
 
 		 336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  28.44 
 
 		 342 aa  126  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  26.89 
 
 		 354 aa  126  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  27.78 
 
 		 324 aa  122  7e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  28.04 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  28.04 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  25.3 
 
 		 338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  26.23 
 
 		 315 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  26.6 
 
 		 323 aa  115  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  30.89 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  26.25 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  27.53 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  22.85 
 
 		 332 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  26.87 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  23.75 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  29.35 
 
 		 334 aa  99  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  23.97 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  21.74 
 
 		 350 aa  97.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  25.63 
 
 		 332 aa  96.7  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  28.57 
 
 		 333 aa  95.9  9e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1185  DNA polymerase III, delta subunit  29.52 
 
 		 337 aa  94.4  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  24.68 
 
 		 306 aa  93.2  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  24.93 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  25.08 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18561  DNA polymerase III subunit delta  25 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.318986  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0083  DNA polymerase III subunit delta  27.03 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  24.64 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  24.92 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18371  DNA polymerase III subunit delta  24.68 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.926744  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  24.12 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  23.68 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  25.07 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1819  DNA polymerase III subunit delta  25.8 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0075815  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1739  DNA polymerase III subunit delta  23.72 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.353532  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  24.47 
 
 		 331 aa  75.9  0.0000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  24.57 
 
 		 334 aa  75.9  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2524  DNA polymerase III, delta subunit  28.52 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  22.57 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl368  hypothetical protein  25.18 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.42314e-33  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  24.08 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  23.19 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18371  DNA polymerase III subunit delta  22.92 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  24.64 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  24.29 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  25.76 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1564  DNA polymerase III, delta subunit  23.6 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  21.81 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  25.82 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00831  DNA polymerase III subunit delta  21.26 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0542  DNA polymerase III subunit delta  22.98 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  23.17 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2277  DNA-directed DNA polymerase  24.23 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  21.45 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2450  DNA polymerase III delta  21.86 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  23.38 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1188  DNA polymerase III delta  27.54 
 
 		 481 aa  70.5  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  24.33 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0072  DNA polymerase III subunit delta  22.06 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  22.93 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3310  DNA polymerase III subunit delta  24.92 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  25.09 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  25.09 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  22.41 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  25.09 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  22.61 
 
 		 344 aa  69.3  0.00000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2643  DNA polymerase III delta  23.08 
 
 		 465 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.640938  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  24.46 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1313  DNA polymerase III, delta  23.32 
 
 		 465 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2547  DNA polymerase III delta  23.08 
 
 		 465 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0981779  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  23.33 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  25.29 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  22.84 
 
 		 336 aa  67  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0772  hypothetical protein  27.66 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.421798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>