247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2298 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 334 aa  683    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  75.82 
 
 		 337 aa  536  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  64.85 
 
 		 331 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  57.45 
 
 		 329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  58.36 
 
 		 329 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  51.82 
 
 		 338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  45.59 
 
 		 336 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  41.1 
 
 		 330 aa  262  8e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  33.13 
 
 		 332 aa  177  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  33.63 
 
 		 338 aa  172  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  34.05 
 
 		 330 aa  166  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  33.12 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  29.75 
 
 		 348 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  30.63 
 
 		 346 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  31.36 
 
 		 344 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  28.85 
 
 		 378 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  26.13 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  29.08 
 
 		 336 aa  149  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  28.78 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  28.78 
 
 		 336 aa  146  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  29.41 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  28.78 
 
 		 336 aa  146  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  31.41 
 
 		 335 aa  146  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  32.29 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  27.25 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  28.78 
 
 		 336 aa  143  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  28.78 
 
 		 336 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  28.78 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  28.78 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  28.78 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  28.78 
 
 		 336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  28.78 
 
 		 336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  28.65 
 
 		 344 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  32.89 
 
 		 354 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  31.89 
 
 		 334 aa  136  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  28.7 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  29.9 
 
 		 339 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  30.77 
 
 		 336 aa  132  9e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  26.07 
 
 		 325 aa  132  9e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  30.7 
 
 		 315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  25.51 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  27.94 
 
 		 331 aa  123  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  32.35 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  25.71 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  23.46 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  23.53 
 
 		 323 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  27.81 
 
 		 334 aa  115  7.999999999999999e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  25.4 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  29.81 
 
 		 336 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  25.24 
 
 		 324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  25.24 
 
 		 324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  25.81 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  22.49 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  25.71 
 
 		 342 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  27.35 
 
 		 374 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  24.62 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  25.24 
 
 		 328 aa  103  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  26.14 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  23.77 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2304  DNA polymerase III, delta subunit  25.08 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477598  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  26.67 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2150  DNA polymerase III, delta subunit  26.2 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  25.45 
 
 		 333 aa  99.8  6e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2577  DNA polymerase III, delta subunit  25.3 
 
 		 346 aa  99.4  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1185  DNA polymerase III, delta subunit  24.16 
 
 		 337 aa  97.1  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1188  DNA polymerase III delta  33.85 
 
 		 481 aa  97.1  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1965  DNA polymerase III, delta subunit  24.77 
 
 		 349 aa  95.1  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2201  DNA polymerase III, delta subunit  23.87 
 
 		 348 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.638698 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  26.75 
 
 		 346 aa  95.1  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0260  DNA polymerase III, delta subunit  24.47 
 
 		 346 aa  94  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  25.83 
 
 		 328 aa  93.2  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0224  DNA polymerase III, delta subunit  24.02 
 
 		 346 aa  92.4  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  26.32 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  26.09 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  28.18 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  25.63 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  25.86 
 
 		 343 aa  90.1  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  24.93 
 
 		 342 aa  89  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  30.43 
 
 		 342 aa  89  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  23.63 
 
 		 399 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  22.67 
 
 		 348 aa  86.7  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  24.5 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  26.03 
 
 		 331 aa  85.5  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  22.67 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  27.38 
 
 		 332 aa  82.8  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5512  DNA polymerase III, delta subunit  23.2 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.504789 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2643  DNA polymerase III delta  30.34 
 
 		 465 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.640938  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  23.26 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2547  DNA polymerase III delta  29.91 
 
 		 465 aa  79.7  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0981779  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1313  DNA polymerase III, delta  29.49 
 
 		 465 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  21.88 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1564  DNA polymerase III, delta subunit  25.53 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  23.63 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  25.74 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  25.38 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  25.74 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2917  DNA polymerase III, delta subunit  24.81 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  25.81 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  23.62 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  23.62 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>