59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2201 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2201  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 348 aa  722    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.638698 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1965  DNA polymerase III, delta subunit  68.88 
 
 		 349 aa  524  1e-148  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0260  DNA polymerase III, delta subunit  62.69 
 
 		 346 aa  457  1e-127  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2577  DNA polymerase III, delta subunit  60.9 
 
 		 346 aa  449  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2150  DNA polymerase III, delta subunit  59.37 
 
 		 348 aa  441  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2304  DNA polymerase III, delta subunit  59.21 
 
 		 357 aa  431  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477598  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0224  DNA polymerase III, delta subunit  56.12 
 
 		 346 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  25.99 
 
 		 350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  28.35 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  25.22 
 
 		 344 aa  106  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  25.99 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  26.65 
 
 		 344 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  25.53 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  26.75 
 
 		 334 aa  97.8  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  23.87 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  24.78 
 
 		 329 aa  94.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  27.03 
 
 		 338 aa  92  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  24.24 
 
 		 336 aa  91.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  24.2 
 
 		 329 aa  90.1  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  24.25 
 
 		 336 aa  89.4  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  26.56 
 
 		 331 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  25.53 
 
 		 339 aa  87.4  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  26.16 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  28.88 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  23.93 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  25.3 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  24.48 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  23.46 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  22.19 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  20.35 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  22.15 
 
 		 335 aa  67  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  22.39 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  22.63 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  23.15 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  21.3 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  24.85 
 
 		 342 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  21.24 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  21.24 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  25.73 
 
 		 399 aa  53.9  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  22.26 
 
 		 346 aa  53.1  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  21.24 
 
 		 336 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  25.53 
 
 		 419 aa  52.8  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  21.24 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  21.24 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  21.24 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  21.24 
 
 		 336 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  21.24 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2001  DNA polymerase III, delta subunit  20.65 
 
 		 341 aa  51.2  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.152484  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  21.24 
 
 		 336 aa  50.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  20.94 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  23.49 
 
 		 336 aa  50.1  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  22.33 
 
 		 323 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  20.13 
 
 		 325 aa  49.7  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  20 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  21.15 
 
 		 342 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  22.1 
 
 		 374 aa  46.6  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0729  hypothetical protein  23.33 
 
 		 338 aa  46.2  0.0009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0375317  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  21.45 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  23.05 
 
 		 345 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>