136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2629 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 350 aa  704    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  26.13 
 
 		 334 aa  150  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  28.61 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  27.81 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  30.16 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  27.57 
 
 		 338 aa  143  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  25.08 
 
 		 331 aa  143  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  25.57 
 
 		 331 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  30.42 
 
 		 341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  27.36 
 
 		 329 aa  136  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  29.25 
 
 		 330 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  27.69 
 
 		 339 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  29.93 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  27.36 
 
 		 329 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  30.07 
 
 		 334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  29.61 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  26.5 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  26.28 
 
 		 338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0260  DNA polymerase III, delta subunit  26.73 
 
 		 346 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2577  DNA polymerase III, delta subunit  26.54 
 
 		 346 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2201  DNA polymerase III, delta subunit  26.19 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.638698 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  26.81 
 
 		 330 aa  113  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0224  DNA polymerase III, delta subunit  25.3 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  27.81 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1965  DNA polymerase III, delta subunit  25.37 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2150  DNA polymerase III, delta subunit  24.64 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  26.27 
 
 		 332 aa  106  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  22.97 
 
 		 378 aa  106  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2304  DNA polymerase III, delta subunit  26.07 
 
 		 357 aa  105  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477598  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  24.07 
 
 		 344 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  24.22 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  27.3 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  21.74 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  22.62 
 
 		 336 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  22.62 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  22.62 
 
 		 336 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  23.19 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  23.19 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  22.92 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  23.19 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  23.19 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  22.89 
 
 		 336 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  22.89 
 
 		 336 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  23.36 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  22.59 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  21.45 
 
 		 338 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  23.19 
 
 		 346 aa  86.3  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  21.14 
 
 		 325 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  26.36 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  20.87 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  28.88 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  18.79 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  23.1 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  24.25 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  18.64 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  23.3 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  27.67 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  27.67 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  28.13 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  18.64 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  18.81 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  18.81 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0212  DNA polymerase III subunit delta  30.3 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  24.06 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  21.71 
 
 		 335 aa  67  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  31.68 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  26.04 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  17.34 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  19.5 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  23.48 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  26.88 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  29.08 
 
 		 336 aa  62  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  24.7 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  23.5 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  21.71 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  21.97 
 
 		 343 aa  57  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  22.64 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  22.33 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  20.66 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2001  DNA polymerase III, delta subunit  23.89 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.152484  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  21.51 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  22.93 
 
 		 327 aa  55.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0083  DNA polymerase III subunit delta  22.87 
 
 		 319 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2917  DNA polymerase III, delta subunit  22.08 
 
 		 342 aa  54.7  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  19.41 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0179  DNA polymerase III, delta subunit  22.95 
 
 		 331 aa  53.9  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  27.03 
 
 		 328 aa  53.5  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  21.9 
 
 		 330 aa  53.1  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  27.07 
 
 		 306 aa  52.8  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  20.31 
 
 		 325 aa  52  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0551  DNA polymerase III subunit delta  25.1 
 
 		 364 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0556298  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  24.68 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1188  DNA polymerase III delta  23.41 
 
 		 481 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0577  DNA polymerase III subunit delta  25.1 
 
 		 364 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0173  DNA polymerase III subunit delta  25.1 
 
 		 364 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0656  DNA polymerase III subunit delta  25.1 
 
 		 364 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121282  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0072  DNA polymerase III subunit delta  26.63 
 
 		 321 aa  49.7  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2277  DNA-directed DNA polymerase  25.42 
 
 		 344 aa  49.7  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  15.96 
 
 		 328 aa  49.3  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>