189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3379 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 346 aa  694    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  28.17 
 
 		 336 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3629  DNA polymerase III subunit delta  31.61 
 
 		 342 aa  96.3  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.628858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  26.75 
 
 		 334 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  26.32 
 
 		 331 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  25.62 
 
 		 337 aa  90.5  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  27 
 
 		 329 aa  89.4  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  28.22 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  25.16 
 
 		 338 aa  87  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  24.32 
 
 		 330 aa  85.9  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2277  DNA-directed DNA polymerase  29.3 
 
 		 344 aa  85.9  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  26.49 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  26.36 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  26.27 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1451  DNA polymerase III subunit delta  27.41 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0184698  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  26.74 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  25.6 
 
 		 328 aa  80.5  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  24.28 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  24.56 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  24.27 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4354  DNA polymerase III subunit delta  27.83 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  26.79 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  24.27 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  24.33 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  24.66 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  24.27 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  24.27 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  24.27 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  23.68 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4814  DNA polymerase III, delta subunit  27.51 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.664461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  23.98 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  24.27 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  23.98 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  23.48 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  25.53 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  25.15 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  28.13 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  25.1 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  28.13 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  28.61 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  23.7 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  25.3 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  27.82 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  26.29 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2577  DNA polymerase III, delta subunit  25.08 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1965  DNA polymerase III, delta subunit  25.08 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  22.26 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  22.26 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0093  DNA polymerase III subunit delta  27.55 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0639  DNA polymerase III subunit delta  27.85 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.858672 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3317  DNA polymerase III subunit delta  27.31 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  23.44 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  26.25 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  22.89 
 
 		 342 aa  67  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1720  DNA polymerase III, delta subunit  27.21 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0043  DNA polymerase III, delta subunit  26.59 
 
 		 342 aa  67  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.302173 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0457  DNA polymerase III, delta subunit  27.24 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0617  DNA polymerase III, delta subunit  27.24 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.733396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  27.9 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4384  DNA polymerase III subunit delta  28.34 
 
 		 347 aa  65.9  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  20.48 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  24.35 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  25.57 
 
 		 338 aa  65.9  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  28.25 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0513  DNA polymerase III, delta subunit  28.02 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  20.13 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1564  DNA polymerase III, delta subunit  27.5 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1448  DNA polymerase III subunit delta  26.07 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0286  DNA polymerase III subunit delta  25.63 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1977  DNA polymerase III subunit delta  27.67 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.286095  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0260  DNA polymerase III, delta subunit  21.75 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0863  DNA polymerase III subunit delta  28.02 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  21.71 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2057  DNA polymerase III subunit delta  27.63 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  21.71 
 
 		 348 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  22.46 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1024  DNA polymerase III subunit delta  27.1 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4252  DNA polymerase III subunit delta  25.79 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.400931 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  26.09 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  29.35 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  24.65 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0434  DNA polymerase III subunit delta  25.66 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0100  DNA polymerase III subunit delta  25.86 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  27.78 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1652  DNA polymerase III subunit delta  26.51 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.884155 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1866  DNA polymerase III subunit delta  26.51 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  22.14 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  24.43 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0387  DNA polymerase III subunit delta  25.63 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1587  DNA polymerase III subunit delta  26.51 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0083136 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  24.29 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1278  DNA polymerase III subunit delta  28.01 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  20.91 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  25.96 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2150  DNA polymerase III, delta subunit  21.84 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01876  DNA polymerase III subunit delta  27.98 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.84431  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0402  DNA polymerase III, delta subunit  29.84 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.745977  normal  0.62254 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0050  DNA polymerase III subunit delta  27.93 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3926  DNA polymerase III subunit delta  25.34 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1406  DNA polymerase III subunit delta  27.44 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>