73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0050 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0050  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 		 347 aa  710    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0863  DNA polymerase III subunit delta  54.6 
 
 		 347 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2057  DNA polymerase III subunit delta  53.41 
 
 		 347 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1977  DNA polymerase III subunit delta  53.41 
 
 		 388 aa  387  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.286095  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3317  DNA polymerase III subunit delta  46.02 
 
 		 345 aa  319  6e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4384  DNA polymerase III subunit delta  39.42 
 
 		 347 aa  258  7e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3926  DNA polymerase III subunit delta  38.08 
 
 		 346 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4252  DNA polymerase III subunit delta  36.34 
 
 		 346 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.400931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3200  DNA polymerase III subunit delta  35.76 
 
 		 343 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1448  DNA polymerase III subunit delta  37.61 
 
 		 342 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0093  DNA polymerase III subunit delta  36.63 
 
 		 342 aa  207  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0286  DNA polymerase III subunit delta  35.47 
 
 		 342 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0387  DNA polymerase III subunit delta  34.88 
 
 		 342 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0292  DNA polymerase III subunit delta  35.94 
 
 		 343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.259297  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0100  DNA polymerase III subunit delta  35.69 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0434  DNA polymerase III subunit delta  35.47 
 
 		 342 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0169  DNA polymerase III subunit delta  34.2 
 
 		 342 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1024  DNA polymerase III subunit delta  37.33 
 
 		 342 aa  196  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1866  DNA polymerase III subunit delta  34.88 
 
 		 343 aa  192  7e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1587  DNA polymerase III subunit delta  33.53 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0083136 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1652  DNA polymerase III subunit delta  33.53 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.884155 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4096  DNA polymerase III subunit delta  35.8 
 
 		 345 aa  186  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0146653 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0222  DNA polymerase III, delta subunit  33.04 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1406  DNA polymerase III subunit delta  36.75 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0339  DNA polymerase III, delta subunit  33.83 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00729017 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3629  DNA polymerase III subunit delta  30.33 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.628858  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1278  DNA polymerase III subunit delta  34.19 
 
 		 347 aa  143  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0639  DNA polymerase III subunit delta  30.26 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.858672 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2959  DNA polymerase III, delta subunit  29.74 
 
 		 350 aa  129  7.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2048  DNA polymerase III subunit delta  29.43 
 
 		 334 aa  122  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296688  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0077  DNA polymerase III, delta subunit  23.42 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0126  hypothetical protein  24.6 
 
 		 334 aa  93.6  5e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5028  DNA polymerase III subunit delta  32.99 
 
 		 350 aa  92.8  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2850  DNA polymerase III, delta subunit  23.99 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal  0.104898 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3217  DNA polymerase III, delta subunit  24.46 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0043  DNA polymerase III, delta subunit  26.1 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.302173 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2767  DNA polymerase III, delta subunit  23.26 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0364  hypothetical protein  23.6 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  25.41 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  25.73 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  25.73 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0055  DNA polymerase III, delta subunit  24.85 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000100325 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  25.52 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  27.93 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  25.09 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  24.44 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  24.66 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  24.5 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08980  DNA polymerase III subunit delta  25.32 
 
 		 346 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0881789  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3313  DNA polymerase III, delta subunit  24.12 
 
 		 343 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000619829  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1564  DNA polymerase III, delta subunit  23.6 
 
 		 340 aa  54.3  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  25.87 
 
 		 374 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3449  DNA polymerase III, delta subunit  22.9 
 
 		 343 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0222652  hitchhiker  0.000721711 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3018  DNA polymerase III, delta subunit  21.9 
 
 		 343 aa  53.5  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1096  DNA polymerase III, delta subunit  22.9 
 
 		 343 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00712318  hitchhiker  0.000000000697762 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3271  DNA polymerase III, delta subunit  22.9 
 
 		 343 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00947649  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4354  DNA polymerase III subunit delta  27.54 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  25.17 
 
 		 329 aa  49.7  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4814  DNA polymerase III, delta subunit  25.52 
 
 		 345 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.664461  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  26.78 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2865  DNA polymerase III, delta subunit  24.55 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00085099  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  25.73 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  30 
 
 		 331 aa  46.6  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  28.06 
 
 		 336 aa  46.6  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1189  DNA polymerase III, delta subunit  26.88 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.725755  normal  0.332691 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0999  DNA polymerase III, delta subunit  23.67 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000304897  normal  0.119076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1060  DNA polymerase III, delta subunit  24.08 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0315108  hitchhiker  0.00717458 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2496  DNA polymerase III, delta  21.99 
 
 		 330 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2143  DNA polymerase III, delta subunit  25.49 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  24.81 
 
 		 332 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0838  DNA polymerase III, delta subunit  21.76 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0409  DNA polymerase III, delta subunit  22.44 
 
 		 343 aa  43.1  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0995  DNA polymerase III, delta subunit  23.67 
 
 		 343 aa  42.7  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0109002  normal  0.117484 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>