66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1278 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1278  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 		 347 aa  686    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3629  DNA polymerase III subunit delta  46.69 
 
 		 342 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.628858  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0639  DNA polymerase III subunit delta  40.92 
 
 		 337 aa  215  8e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.858672 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2959  DNA polymerase III, delta subunit  39.77 
 
 		 350 aa  201  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1448  DNA polymerase III subunit delta  38.04 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3317  DNA polymerase III subunit delta  37.93 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0093  DNA polymerase III subunit delta  36.39 
 
 		 342 aa  180  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0169  DNA polymerase III subunit delta  35.96 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0863  DNA polymerase III subunit delta  35.34 
 
 		 347 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2057  DNA polymerase III subunit delta  34.48 
 
 		 347 aa  176  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0286  DNA polymerase III subunit delta  36.55 
 
 		 342 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1977  DNA polymerase III subunit delta  34.67 
 
 		 388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.286095  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0387  DNA polymerase III subunit delta  35.8 
 
 		 342 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0100  DNA polymerase III subunit delta  37.13 
 
 		 342 aa  173  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0292  DNA polymerase III subunit delta  36.87 
 
 		 343 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.259297  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0050  DNA polymerase III subunit delta  34.19 
 
 		 347 aa  171  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4096  DNA polymerase III subunit delta  36.42 
 
 		 345 aa  166  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0146653 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2048  DNA polymerase III subunit delta  37.28 
 
 		 334 aa  164  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296688  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1024  DNA polymerase III subunit delta  35.37 
 
 		 342 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0434  DNA polymerase III subunit delta  34.91 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1587  DNA polymerase III subunit delta  35.42 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0083136 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0339  DNA polymerase III, delta subunit  33.62 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00729017 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5028  DNA polymerase III subunit delta  34.75 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1866  DNA polymerase III subunit delta  34.81 
 
 		 343 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1652  DNA polymerase III subunit delta  34.49 
 
 		 343 aa  152  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.884155 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1406  DNA polymerase III subunit delta  35.28 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3200  DNA polymerase III subunit delta  34.1 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0222  DNA polymerase III, delta subunit  33.72 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4252  DNA polymerase III subunit delta  31.53 
 
 		 346 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.400931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3926  DNA polymerase III subunit delta  32.24 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4384  DNA polymerase III subunit delta  30.62 
 
 		 347 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0043  DNA polymerase III, delta subunit  31.53 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.302173 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0055  DNA polymerase III, delta subunit  30.81 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000100325 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0409  DNA polymerase III, delta subunit  29.53 
 
 		 343 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0077  DNA polymerase III, delta subunit  22.46 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0126  hypothetical protein  24.03 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2496  DNA polymerase III, delta  31.78 
 
 		 330 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2850  DNA polymerase III, delta subunit  30.86 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal  0.104898 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0838  DNA polymerase III, delta subunit  32.46 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0364  hypothetical protein  21.71 
 
 		 330 aa  97.4  3e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3137  DNA polymerase III, delta  29.46 
 
 		 330 aa  93.2  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.226338  hitchhiker  0.0000037205 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2767  DNA polymerase III, delta subunit  28.12 
 
 		 342 aa  92  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3018  DNA polymerase III, delta subunit  26.59 
 
 		 343 aa  89.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3217  DNA polymerase III, delta subunit  26.54 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  28.01 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  25.64 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  25.64 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  24 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  24 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08980  DNA polymerase III subunit delta  25.33 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0881789  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  24.67 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  25.68 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  25.35 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  25.91 
 
 		 344 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  28.99 
 
 		 328 aa  53.5  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2277  DNA-directed DNA polymerase  26.45 
 
 		 344 aa  52.8  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  26.28 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  26.36 
 
 		 332 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  22.82 
 
 		 344 aa  51.2  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1404  DNA polymerase III, delta subunit  28.31 
 
 		 389 aa  50.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  24.18 
 
 		 329 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2443  DNA polymerase III, delta subunit  31.88 
 
 		 344 aa  47  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0179  DNA polymerase III, delta subunit  28.09 
 
 		 331 aa  43.1  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  24.18 
 
 		 329 aa  43.5  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  21.07 
 
 		 331 aa  43.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>