93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3629 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3629  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 		 342 aa  664    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.628858  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1278  DNA polymerase III subunit delta  46.69 
 
 		 347 aa  249  7e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2959  DNA polymerase III, delta subunit  37.85 
 
 		 350 aa  192  6e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0639  DNA polymerase III subunit delta  35.96 
 
 		 337 aa  182  7e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.858672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0169  DNA polymerase III subunit delta  34.52 
 
 		 342 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1866  DNA polymerase III subunit delta  38.98 
 
 		 343 aa  179  9e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1587  DNA polymerase III subunit delta  38.98 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0083136 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0286  DNA polymerase III subunit delta  33.04 
 
 		 342 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1448  DNA polymerase III subunit delta  37.46 
 
 		 342 aa  176  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1652  DNA polymerase III subunit delta  38.02 
 
 		 343 aa  176  7e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.884155 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0093  DNA polymerase III subunit delta  33.33 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0863  DNA polymerase III subunit delta  33.76 
 
 		 347 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2057  DNA polymerase III subunit delta  31.33 
 
 		 347 aa  172  7.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1024  DNA polymerase III subunit delta  36.72 
 
 		 342 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0387  DNA polymerase III subunit delta  32.25 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2048  DNA polymerase III subunit delta  36.76 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296688  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1977  DNA polymerase III subunit delta  32.4 
 
 		 388 aa  169  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.286095  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0292  DNA polymerase III subunit delta  33.04 
 
 		 343 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.259297  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0100  DNA polymerase III subunit delta  32.74 
 
 		 342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3317  DNA polymerase III subunit delta  36.89 
 
 		 345 aa  164  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0434  DNA polymerase III subunit delta  31.85 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0050  DNA polymerase III subunit delta  30.33 
 
 		 347 aa  160  3e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4096  DNA polymerase III subunit delta  35.83 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0146653 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5028  DNA polymerase III subunit delta  35.28 
 
 		 350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1406  DNA polymerase III subunit delta  37.05 
 
 		 342 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4384  DNA polymerase III subunit delta  31.15 
 
 		 347 aa  153  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3926  DNA polymerase III subunit delta  30.23 
 
 		 346 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4252  DNA polymerase III subunit delta  28.83 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.400931 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0339  DNA polymerase III, delta subunit  33.66 
 
 		 338 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00729017 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0222  DNA polymerase III, delta subunit  33.97 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0043  DNA polymerase III, delta subunit  33.92 
 
 		 342 aa  139  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.302173 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3200  DNA polymerase III subunit delta  31.27 
 
 		 343 aa  139  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0055  DNA polymerase III, delta subunit  34.12 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000100325 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0077  DNA polymerase III, delta subunit  21.26 
 
 		 334 aa  126  5e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0364  hypothetical protein  25.23 
 
 		 330 aa  124  3e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0409  DNA polymerase III, delta subunit  32.94 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2850  DNA polymerase III, delta subunit  30.17 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal  0.104898 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0126  hypothetical protein  21.26 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  31.12 
 
 		 346 aa  103  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3137  DNA polymerase III, delta  32.74 
 
 		 330 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.226338  hitchhiker  0.0000037205 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2767  DNA polymerase III, delta subunit  30.97 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0838  DNA polymerase III, delta subunit  31.59 
 
 		 330 aa  99.4  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2496  DNA polymerase III, delta  31.59 
 
 		 330 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4354  DNA polymerase III subunit delta  28.77 
 
 		 345 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4814  DNA polymerase III, delta subunit  28.77 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.664461  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  27.37 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  27.66 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3217  DNA polymerase III, delta subunit  26.65 
 
 		 340 aa  79.3  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  27.21 
 
 		 345 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  27.21 
 
 		 345 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08980  DNA polymerase III subunit delta  29.29 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0881789  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  29.51 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  26.97 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  26.97 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  26.97 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3018  DNA polymerase III, delta subunit  25.94 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  27.03 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  25.08 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  21.77 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  26.65 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  24.1 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1720  DNA polymerase III, delta subunit  23.49 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  24.77 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  26.85 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  22.8 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0083  DNA polymerase III subunit delta  23.9 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  23.77 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  23.75 
 
 		 330 aa  53.9  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  32.53 
 
 		 332 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21151  DNA polymerase III subunit delta  21.72 
 
 		 342 aa  53.1  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1245  DNA polymerase III subunit delta  21.72 
 
 		 342 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  27.17 
 
 		 315 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  23.72 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  26.52 
 
 		 374 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0212  DNA polymerase III subunit delta  24.62 
 
 		 316 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  23.87 
 
 		 338 aa  49.7  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  27.22 
 
 		 350 aa  49.3  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1172  DNA polymerase III, delta subunit  20 
 
 		 343 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1060  DNA polymerase III, delta subunit  20.87 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0315108  hitchhiker  0.00717458 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  21.41 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  24.54 
 
 		 344 aa  47.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2143  DNA polymerase III, delta subunit  28.71 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  25.55 
 
 		 335 aa  47.4  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0995  DNA polymerase III, delta subunit  20 
 
 		 343 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0109002  normal  0.117484 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1564  DNA polymerase III, delta subunit  20.28 
 
 		 340 aa  46.2  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01220  DNA polymerase III subunit delta  24.44 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0999  DNA polymerase III, delta subunit  20.25 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000304897  normal  0.119076 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.52 
 
 		 551 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  17.96 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  26.84 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  17.18 
 
 		 324 aa  43.5  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  17.88 
 
 		 324 aa  42.7  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  17.88 
 
 		 324 aa  42.7  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>