60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4252 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4252  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 		 346 aa  702    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.400931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3926  DNA polymerase III subunit delta  93.64 
 
 		 346 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4384  DNA polymerase III subunit delta  60.29 
 
 		 347 aa  443  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3200  DNA polymerase III subunit delta  60.76 
 
 		 343 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1977  DNA polymerase III subunit delta  40.87 
 
 		 388 aa  288  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.286095  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2057  DNA polymerase III subunit delta  40.58 
 
 		 347 aa  287  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0863  DNA polymerase III subunit delta  40.29 
 
 		 347 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3317  DNA polymerase III subunit delta  37.9 
 
 		 345 aa  250  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0050  DNA polymerase III subunit delta  36.34 
 
 		 347 aa  245  9.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1024  DNA polymerase III subunit delta  37.25 
 
 		 342 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1448  DNA polymerase III subunit delta  35.16 
 
 		 342 aa  189  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0286  DNA polymerase III subunit delta  34.2 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0100  DNA polymerase III subunit delta  34.01 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0169  DNA polymerase III subunit delta  34.1 
 
 		 342 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0339  DNA polymerase III, delta subunit  33.73 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00729017 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0093  DNA polymerase III subunit delta  33.72 
 
 		 342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1406  DNA polymerase III subunit delta  35.34 
 
 		 342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1652  DNA polymerase III subunit delta  34.57 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.884155 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0387  DNA polymerase III subunit delta  35.07 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1866  DNA polymerase III subunit delta  34.48 
 
 		 343 aa  176  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0434  DNA polymerase III subunit delta  34.78 
 
 		 342 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1587  DNA polymerase III subunit delta  34.48 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0083136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4096  DNA polymerase III subunit delta  37.2 
 
 		 345 aa  173  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0146653 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0292  DNA polymerase III subunit delta  34.1 
 
 		 343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.259297  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0222  DNA polymerase III, delta subunit  31.56 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3629  DNA polymerase III subunit delta  29.9 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.628858  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1278  DNA polymerase III subunit delta  31.53 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2959  DNA polymerase III, delta subunit  32.34 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0639  DNA polymerase III subunit delta  31.21 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.858672 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2048  DNA polymerase III subunit delta  28.21 
 
 		 334 aa  110  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296688  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5028  DNA polymerase III subunit delta  30.9 
 
 		 350 aa  96.3  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3217  DNA polymerase III, delta subunit  24.36 
 
 		 340 aa  88.6  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2850  DNA polymerase III, delta subunit  27.1 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal  0.104898 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1404  DNA polymerase III, delta subunit  25.78 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0077  DNA polymerase III, delta subunit  23.59 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2767  DNA polymerase III, delta subunit  25.65 
 
 		 342 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0126  hypothetical protein  26.98 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  25.79 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0043  DNA polymerase III, delta subunit  28.63 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.302173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0999  DNA polymerase III, delta subunit  24.89 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000304897  normal  0.119076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1060  DNA polymerase III, delta subunit  24.05 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0315108  hitchhiker  0.00717458 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1172  DNA polymerase III, delta subunit  23.73 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0995  DNA polymerase III, delta subunit  24.15 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0109002  normal  0.117484 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1564  DNA polymerase III, delta subunit  21.53 
 
 		 340 aa  53.9  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0055  DNA polymerase III, delta subunit  26.72 
 
 		 341 aa  52.8  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000100325 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3018  DNA polymerase III, delta subunit  24.12 
 
 		 343 aa  52  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0838  DNA polymerase III, delta subunit  26.23 
 
 		 330 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2496  DNA polymerase III, delta  25.93 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3313  DNA polymerase III, delta subunit  22.74 
 
 		 343 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000619829  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1096  DNA polymerase III, delta subunit  22.74 
 
 		 343 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00712318  hitchhiker  0.000000000697762 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3271  DNA polymerase III, delta subunit  22.74 
 
 		 343 aa  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00947649  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0409  DNA polymerase III, delta subunit  26.67 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  27.1 
 
 		 331 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  26.22 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3449  DNA polymerase III, delta subunit  22.41 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0222652  hitchhiker  0.000721711 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  23.75 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2277  DNA-directed DNA polymerase  26.32 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  24.26 
 
 		 329 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0364  hypothetical protein  21.18 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  25.68 
 
 		 342 aa  42.7  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>