135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2356 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 374 aa  762    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  24.72 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  27.35 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  25.57 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  23.68 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  23.93 
 
 		 336 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  23.93 
 
 		 336 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  23.93 
 
 		 336 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  23.93 
 
 		 336 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  23.93 
 
 		 336 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  23.93 
 
 		 336 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  23.93 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  24.63 
 
 		 336 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  25.29 
 
 		 330 aa  98.6  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  23.08 
 
 		 336 aa  98.6  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  23.93 
 
 		 336 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  26.05 
 
 		 337 aa  96.7  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  24.44 
 
 		 348 aa  96.7  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  23.93 
 
 		 336 aa  96.7  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  26.04 
 
 		 329 aa  94.4  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  26.67 
 
 		 338 aa  93.6  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  24.5 
 
 		 336 aa  93.6  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  23.58 
 
 		 332 aa  93.2  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  26.04 
 
 		 329 aa  90.9  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  23.77 
 
 		 338 aa  91.3  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  25.87 
 
 		 338 aa  89.7  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  24.35 
 
 		 339 aa  87  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  26.09 
 
 		 330 aa  86.7  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  24.37 
 
 		 344 aa  86.3  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  23.7 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  26.67 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  21.78 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  22.49 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  23.63 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  23.1 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  30.73 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  25.76 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  24.38 
 
 		 331 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  23.19 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  23.24 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  21.38 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  21.33 
 
 		 334 aa  72.4  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2834  DNA polymerase III, delta subunit  33.71 
 
 		 325 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.68901 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  21.15 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  25.77 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  20.8 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  25.23 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  23.88 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  25.56 
 
 		 345 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  25.56 
 
 		 345 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  25.56 
 
 		 351 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  22.45 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  23.82 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  24.85 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  23.55 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  23.38 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  20.16 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  25.82 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  24.71 
 
 		 351 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  24.16 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  24.32 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  27.78 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1188  DNA polymerase III delta  29.83 
 
 		 481 aa  59.7  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  24.63 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  21.78 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  18.92 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  22.9 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  22.55 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11893  DNA polymerase III subunit gamma/tau  21.86 
 
 		 600 aa  58.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.272585  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2577  DNA polymerase III, delta subunit  21.35 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  19.71 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  20.55 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  21.23 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  24.75 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  19.71 
 
 		 348 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  22.11 
 
 		 324 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  22.11 
 
 		 324 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2450  DNA polymerase III delta  29.59 
 
 		 458 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  34.92 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  21.65 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  26.1 
 
 		 328 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0050  DNA polymerase III subunit delta  25.87 
 
 		 347 aa  54.3  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  21.76 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0729  hypothetical protein  20.12 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0375317  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4814  DNA polymerase III, delta subunit  24.07 
 
 		 345 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.664461  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  31.75 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4354  DNA polymerase III subunit delta  24.44 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1278  DNA polymerase III subunit delta  26.04 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2547  DNA polymerase III delta  27.55 
 
 		 465 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0981779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  23.62 
 
 		 345 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  23.62 
 
 		 345 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  21.85 
 
 		 335 aa  50.4  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  23.2 
 
 		 325 aa  50.4  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2643  DNA polymerase III delta  28.06 
 
 		 465 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.640938  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0212  DNA polymerase III subunit delta  29.6 
 
 		 316 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  22.55 
 
 		 328 aa  49.7  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1313  DNA polymerase III, delta  28.57 
 
 		 465 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  25.69 
 
 		 319 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  22.51 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  31.25 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>