92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2834 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2834  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 
325 aa  625  1e-178  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.68901 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  26.86 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  28.14 
 
 
354 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  27.34 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  27.24 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  33.71 
 
 
374 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  27.95 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  22.68 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  28.57 
 
 
327 aa  68.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  26.64 
 
 
339 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  21.24 
 
 
331 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  19.94 
 
 
378 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  30.95 
 
 
328 aa  63.5  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  23.51 
 
 
346 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  26.73 
 
 
315 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  27.48 
 
 
323 aa  63.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  24.12 
 
 
348 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0481  DNA polymerase III, delta subunit  25.44 
 
 
338 aa  61.2  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  27.62 
 
 
332 aa  60.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  26.73 
 
 
323 aa  60.1  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  26.32 
 
 
330 aa  59.7  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  24.91 
 
 
338 aa  59.7  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  24.6 
 
 
337 aa  59.3  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  19.47 
 
 
325 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  21.94 
 
 
329 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1378  DNA polymerase III subunit delta  24.43 
 
 
343 aa  57.4  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1720  DNA polymerase III, delta subunit  19.87 
 
 
354 aa  57  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1311  DNA polymerase III subunit delta  24.1 
 
 
343 aa  56.6  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  24.43 
 
 
399 aa  56.2  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  25.33 
 
 
331 aa  56.2  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2910  DNA polymerase III subunit delta  30.46 
 
 
345 aa  56.2  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  23.25 
 
 
344 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2277  DNA-directed DNA polymerase  27.78 
 
 
344 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  22.12 
 
 
329 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  24.43 
 
 
419 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  22.74 
 
 
336 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  22.74 
 
 
336 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  22.74 
 
 
336 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  22.66 
 
 
336 aa  53.1  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  22.74 
 
 
336 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2346  DNA polymerase III subunit delta  31.63 
 
 
352 aa  53.1  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  26.25 
 
 
337 aa  53.1  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  27.73 
 
 
336 aa  52.8  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  23.02 
 
 
336 aa  52.8  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  22.38 
 
 
336 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  18.94 
 
 
341 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  22.38 
 
 
336 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  22.38 
 
 
336 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  22.38 
 
 
336 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  22.38 
 
 
336 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  21.68 
 
 
334 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  22.78 
 
 
339 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  23.35 
 
 
331 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  26.92 
 
 
351 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1096  DNA polymerase III subunit delta  24.05 
 
 
343 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  21.46 
 
 
341 aa  48.9  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  24.2 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0513  DNA polymerase III, delta subunit  25.55 
 
 
338 aa  48.9  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2917  DNA polymerase III, delta subunit  28.46 
 
 
342 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  26.54 
 
 
345 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  19.84 
 
 
323 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0212  DNA polymerase III subunit delta  24.29 
 
 
316 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0670  DNA polymerase III delta  21.25 
 
 
320 aa  47.4  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.840892  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  20.64 
 
 
337 aa  47.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  26.54 
 
 
345 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  28.82 
 
 
342 aa  47  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  25.77 
 
 
351 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1965  DNA polymerase III, delta subunit  22.35 
 
 
349 aa  46.6  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025089  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  24.66 
 
 
334 aa  46.2  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  26.51 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2143  DNA polymerase III, delta subunit  31.69 
 
 
334 aa  45.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3313  DNA polymerase III, delta subunit  18.98 
 
 
343 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000619829  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  21.84 
 
 
342 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3271  DNA polymerase III, delta subunit  18.98 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00947649  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1404  DNA polymerase III, delta subunit  31.69 
 
 
389 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1096  DNA polymerase III, delta subunit  18.98 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00712318  hitchhiker  0.000000000697762 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1189  DNA polymerase III, delta subunit  19.34 
 
 
331 aa  44.3  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.725755  normal  0.332691 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1185  DNA polymerase III, delta subunit  23.36 
 
 
337 aa  44.3  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1564  DNA polymerase III, delta subunit  23.03 
 
 
340 aa  43.9  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  33.03 
 
 
325 aa  43.9  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2960  DNA polymerase III subunit delta  22.44 
 
 
343 aa  43.9  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0234  DNA polymerase III, delta subunit  21.98 
 
 
353 aa  43.5  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0743  DNA polymerase III, delta subunit  21.89 
 
 
324 aa  43.5  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0256  DNA polymerase III, delta subunit  21.73 
 
 
353 aa  43.5  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0767  DNA polymerase III, delta subunit  21.89 
 
 
324 aa  43.5  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  25.31 
 
 
330 aa  43.1  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  22.05 
 
 
334 aa  42.7  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3146  DNA polymerase III subunit delta  22.8 
 
 
341 aa  43.1  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  25.29 
 
 
345 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  20.8 
 
 
328 aa  42.7  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  26.72 
 
 
345 aa  42.7  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  27.98 
 
 
345 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>