159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1311 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1311  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 		 343 aa  695    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1378  DNA polymerase III subunit delta  99.42 
 
 		 343 aa  692    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01876  DNA polymerase III subunit delta  71.72 
 
 		 342 aa  491  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.84431  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2910  DNA polymerase III subunit delta  67.93 
 
 		 345 aa  466  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  37.94 
 
 		 345 aa  228  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  39.59 
 
 		 345 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  39.59 
 
 		 345 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  39 
 
 		 351 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  37.61 
 
 		 344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  37.94 
 
 		 351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  35.38 
 
 		 342 aa  205  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3310  DNA polymerase III subunit delta  36.8 
 
 		 348 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2277  DNA-directed DNA polymerase  38.81 
 
 		 344 aa  203  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  37.08 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08980  DNA polymerase III subunit delta  37.96 
 
 		 346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0881789  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4354  DNA polymerase III subunit delta  38.05 
 
 		 345 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0513  DNA polymerase III, delta subunit  35.59 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4814  DNA polymerase III, delta subunit  37.76 
 
 		 345 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.664461  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0402  DNA polymerase III, delta subunit  37.46 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.745977  normal  0.62254 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  36.78 
 
 		 345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2143  DNA polymerase III, delta subunit  36.47 
 
 		 334 aa  187  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1451  DNA polymerase III subunit delta  36.09 
 
 		 334 aa  182  7e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0184698  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0542  DNA polymerase III subunit delta  38.55 
 
 		 335 aa  182  7e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0481  DNA polymerase III subunit delta  36.6 
 
 		 362 aa  176  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  33.53 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2586  DNA polymerase III subunit delta  37.54 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000748546 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2451  DNA polymerase III subunit delta  38.69 
 
 		 362 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3449  DNA polymerase III subunit delta  38.69 
 
 		 362 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.785603  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0368  DNA polymerase III subunit delta  38.69 
 
 		 362 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1227  DNA polymerase III subunit delta  38.69 
 
 		 362 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.859093  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3413  DNA polymerase III subunit delta  38.69 
 
 		 362 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3448  DNA polymerase III subunit delta  38.69 
 
 		 362 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2638  DNA polymerase III subunit delta  38.69 
 
 		 362 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2742  DNA polymerase III subunit delta  35.03 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1508  DNA polymerase III, delta subunit  35.42 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0182978  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0760  DNA polymerase III subunit delta  37.75 
 
 		 354 aa  169  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2157  DNA polymerase III, delta subunit  34.93 
 
 		 338 aa  169  8e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0671  DNA polymerase III, delta subunit  35.12 
 
 		 339 aa  169  8e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00374825  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1213  DNA polymerase III subunit delta  37.7 
 
 		 362 aa  169  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0577  DNA polymerase III subunit delta  37.7 
 
 		 364 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2832  DNA polymerase III subunit delta  35.91 
 
 		 352 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0551  DNA polymerase III subunit delta  37.7 
 
 		 364 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0556298  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0578  DNA polymerase III subunit delta  37.42 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2971  DNA polymerase III subunit delta  35.24 
 
 		 356 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3742  DNA polymerase III subunit delta  37.7 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0768215 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0424  DNA polymerase III subunit delta  36.03 
 
 		 361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.813345  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0216  DNA polymerase III subunit delta  35.26 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.533896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2571  DNA polymerase III subunit delta  35.16 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225423  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0173  DNA polymerase III subunit delta  37.38 
 
 		 364 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0656  DNA polymerase III subunit delta  37.38 
 
 		 364 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121282  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0623  DNA polymerase III subunit delta  37.05 
 
 		 364 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2981  DNA polymerase III subunit delta  34.52 
 
 		 358 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2346  DNA polymerase III subunit delta  35.67 
 
 		 352 aa  159  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1564  DNA polymerase III, delta subunit  33.33 
 
 		 340 aa  158  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3378  DNA polymerase III subunit delta  37.94 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.930897  hitchhiker  0.00000000672182 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0481  DNA polymerase III, delta subunit  33.02 
 
 		 338 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2730  DNA polymerase III subunit delta  36.72 
 
 		 364 aa  153  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.969457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4600  DNA polymerase III subunit delta  32.07 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3915  DNA polymerase III subunit delta  34.33 
 
 		 348 aa  150  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3264  DNA polymerase III subunit delta  34.33 
 
 		 348 aa  150  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01661  putative DNA polymerase III, delta subunit, probably ATP hydrolase  34.19 
 
 		 320 aa  150  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000516884  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1200  DNA polymerase III subunit delta  35.91 
 
 		 336 aa  149  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.972787  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0256  DNA polymerase III, delta subunit  31.48 
 
 		 353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0234  DNA polymerase III, delta subunit  32.1 
 
 		 353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6001  DNA polymerase III subunit delta  36.18 
 
 		 350 aa  145  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3769  DNA polymerase III subunit delta  31.91 
 
 		 367 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0964  DNA polymerase III subunit delta  34.23 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2917  DNA polymerase III, delta subunit  30.84 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0995  DNA polymerase III, delta subunit  30.84 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0109002  normal  0.117484 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1172  DNA polymerase III, delta subunit  30.84 
 
 		 343 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1060  DNA polymerase III, delta subunit  30.84 
 
 		 343 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0315108  hitchhiker  0.00717458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4546  DNA polymerase III subunit delta  34.23 
 
 		 348 aa  139  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0999  DNA polymerase III, delta subunit  30.54 
 
 		 343 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000304897  normal  0.119076 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2931  DNA polymerase III, delta subunit  31.63 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.118412  decreased coverage  0.00725914 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2443  DNA polymerase III, delta subunit  33.93 
 
 		 344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3313  DNA polymerase III, delta subunit  30.84 
 
 		 343 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000619829  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3449  DNA polymerase III, delta subunit  30.84 
 
 		 343 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0222652  hitchhiker  0.000721711 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1096  DNA polymerase III, delta subunit  30.84 
 
 		 343 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00712318  hitchhiker  0.000000000697762 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3271  DNA polymerase III, delta subunit  30.84 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00947649  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0703  DNA polymerase III, delta subunit  28.31 
 
 		 344 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000446236  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1189  DNA polymerase III, delta subunit  27.89 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.725755  normal  0.332691 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2865  DNA polymerase III, delta subunit  31.76 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00085099  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3704  DNA polymerase III, delta subunit  29.93 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000203003  decreased coverage  0.000000325428 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2130  DNA polymerase III, delta subunit  32.7 
 
 		 358 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0903224 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1720  DNA polymerase III, delta subunit  26.65 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2584  DNA-directed DNA polymerase  29.93 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000509755  normal  0.168307 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3481  DNA-directed DNA polymerase  30.41 
 
 		 346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000216936  unclonable  0.0000000000757173 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1742  DNA polymerase III, delta subunit  37.84 
 
 		 335 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.260854  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0795  DNA polymerase III, delta subunit  28.12 
 
 		 343 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.239391  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01220  DNA polymerase III subunit delta  26.33 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0476  DNA polymerase III subunit delta  26.76 
 
 		 342 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.159232  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2960  DNA polymerase III subunit delta  28.61 
 
 		 343 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0988  DNA polymerase III subunit delta  26.49 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3145  DNA polymerase III, delta subunit  30.27 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000700325  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004219  DNA polymerase III delta subunit  26.4 
 
 		 339 aa  109  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00302346  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0703  DNA polymerase III subunit delta  30.21 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0770621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0689  DNA polymerase III subunit delta  30.21 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00596065  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0762  DNA polymerase III subunit delta  30.21 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0692  DNA polymerase III subunit delta  29.91 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000216936  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0666  DNA polymerase III subunit delta  29.91 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000205044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>