150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2586 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2586  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 		 375 aa  739    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000748546 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0578  DNA polymerase III subunit delta  85.33 
 
 		 372 aa  620  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3378  DNA polymerase III subunit delta  85.03 
 
 		 372 aa  594  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.930897  hitchhiker  0.00000000672182 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2451  DNA polymerase III subunit delta  84.42 
 
 		 362 aa  594  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3449  DNA polymerase III subunit delta  84.42 
 
 		 362 aa  594  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.785603  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0368  DNA polymerase III subunit delta  84.42 
 
 		 362 aa  594  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1227  DNA polymerase III subunit delta  84.42 
 
 		 362 aa  594  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.859093  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3413  DNA polymerase III subunit delta  84.42 
 
 		 362 aa  594  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3448  DNA polymerase III subunit delta  84.42 
 
 		 362 aa  594  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2638  DNA polymerase III subunit delta  84.42 
 
 		 362 aa  594  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1213  DNA polymerase III subunit delta  81.79 
 
 		 362 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0173  DNA polymerase III subunit delta  83.19 
 
 		 364 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0656  DNA polymerase III subunit delta  83.19 
 
 		 364 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121282  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3742  DNA polymerase III subunit delta  83.19 
 
 		 364 aa  570  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0768215 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0623  DNA polymerase III subunit delta  82.62 
 
 		 364 aa  567  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0551  DNA polymerase III subunit delta  83.48 
 
 		 364 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0556298  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0577  DNA polymerase III subunit delta  83.19 
 
 		 364 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2730  DNA polymerase III subunit delta  83.95 
 
 		 364 aa  534  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.969457  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2742  DNA polymerase III subunit delta  64.13 
 
 		 358 aa  448  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2981  DNA polymerase III subunit delta  66.01 
 
 		 358 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2571  DNA polymerase III subunit delta  66.57 
 
 		 358 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225423  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2832  DNA polymerase III subunit delta  64.07 
 
 		 352 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2971  DNA polymerase III subunit delta  64.87 
 
 		 356 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0234  DNA polymerase III, delta subunit  55.84 
 
 		 353 aa  377  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3915  DNA polymerase III subunit delta  59.54 
 
 		 348 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3264  DNA polymerase III subunit delta  59.26 
 
 		 348 aa  371  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0256  DNA polymerase III, delta subunit  54.13 
 
 		 353 aa  369  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0424  DNA polymerase III subunit delta  55.07 
 
 		 361 aa  371  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.813345  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4546  DNA polymerase III subunit delta  58.07 
 
 		 348 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4600  DNA polymerase III subunit delta  53.62 
 
 		 374 aa  362  6e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0760  DNA polymerase III subunit delta  57.55 
 
 		 354 aa  359  4e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0216  DNA polymerase III subunit delta  57.83 
 
 		 363 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.533896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6001  DNA polymerase III subunit delta  56.9 
 
 		 350 aa  354  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0481  DNA polymerase III subunit delta  54.39 
 
 		 362 aa  352  7e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0964  DNA polymerase III subunit delta  56.41 
 
 		 351 aa  350  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3769  DNA polymerase III subunit delta  53.57 
 
 		 367 aa  349  6e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0542  DNA polymerase III subunit delta  54.63 
 
 		 335 aa  333  4e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0513  DNA polymerase III, delta subunit  47.41 
 
 		 338 aa  305  7e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1200  DNA polymerase III subunit delta  48.42 
 
 		 336 aa  278  9e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.972787  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2157  DNA polymerase III, delta subunit  43.68 
 
 		 338 aa  261  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2443  DNA polymerase III, delta subunit  45.04 
 
 		 344 aa  244  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  43.63 
 
 		 351 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3310  DNA polymerase III subunit delta  38.38 
 
 		 348 aa  242  9e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  42.61 
 
 		 345 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  42.61 
 
 		 345 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  42.9 
 
 		 351 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  41.76 
 
 		 345 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2277  DNA-directed DNA polymerase  44.04 
 
 		 344 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08980  DNA polymerase III subunit delta  43.18 
 
 		 346 aa  232  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0881789  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4354  DNA polymerase III subunit delta  42.61 
 
 		 345 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4814  DNA polymerase III, delta subunit  42.05 
 
 		 345 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.664461  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  42.05 
 
 		 342 aa  229  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  41.95 
 
 		 345 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  42.25 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  38.11 
 
 		 344 aa  227  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2346  DNA polymerase III subunit delta  40.34 
 
 		 352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1451  DNA polymerase III subunit delta  39.43 
 
 		 334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0184698  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0402  DNA polymerase III, delta subunit  42.6 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.745977  normal  0.62254 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1564  DNA polymerase III, delta subunit  36.39 
 
 		 340 aa  206  6e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01661  putative DNA polymerase III, delta subunit, probably ATP hydrolase  37.46 
 
 		 320 aa  203  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000516884  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2917  DNA polymerase III, delta subunit  35.6 
 
 		 342 aa  200  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  35.38 
 
 		 337 aa  196  8.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2931  DNA polymerase III, delta subunit  35.69 
 
 		 343 aa  192  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.118412  decreased coverage  0.00725914 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1172  DNA polymerase III, delta subunit  32.69 
 
 		 343 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0999  DNA polymerase III, delta subunit  33.15 
 
 		 343 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000304897  normal  0.119076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1060  DNA polymerase III, delta subunit  33.43 
 
 		 343 aa  189  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0315108  hitchhiker  0.00717458 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0995  DNA polymerase III, delta subunit  33.43 
 
 		 343 aa  189  9e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0109002  normal  0.117484 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2143  DNA polymerase III, delta subunit  37.57 
 
 		 334 aa  187  4e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0703  DNA polymerase III, delta subunit  33.65 
 
 		 344 aa  186  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000446236  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0671  DNA polymerase III, delta subunit  36.25 
 
 		 339 aa  176  7e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00374825  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2960  DNA polymerase III subunit delta  32.76 
 
 		 343 aa  176  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1508  DNA polymerase III, delta subunit  36.25 
 
 		 339 aa  176  8e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0182978  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1378  DNA polymerase III subunit delta  37.54 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1311  DNA polymerase III subunit delta  37.54 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3313  DNA polymerase III, delta subunit  32.39 
 
 		 343 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000619829  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1096  DNA polymerase III, delta subunit  32.39 
 
 		 343 aa  172  9e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00712318  hitchhiker  0.000000000697762 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3271  DNA polymerase III, delta subunit  32.39 
 
 		 343 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00947649  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0703  DNA polymerase III subunit delta  35.11 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0770621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0762  DNA polymerase III subunit delta  35.11 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0806  DNA polymerase III subunit delta  35.11 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0749  DNA polymerase III subunit delta  35.11 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0941717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0689  DNA polymerase III subunit delta  35.11 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00596065  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0988  DNA polymerase III subunit delta  27.81 
 
 		 345 aa  169  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3449  DNA polymerase III, delta subunit  32.08 
 
 		 343 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0222652  hitchhiker  0.000721711 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1742  DNA polymerase III, delta subunit  44.91 
 
 		 335 aa  169  9e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.260854  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3481  DNA-directed DNA polymerase  30.81 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000216936  unclonable  0.0000000000757173 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2584  DNA-directed DNA polymerase  34.32 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000509755  normal  0.168307 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2130  DNA polymerase III, delta subunit  37.93 
 
 		 358 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0903224 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0481  DNA polymerase III, delta subunit  31.93 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3704  DNA polymerase III, delta subunit  33.33 
 
 		 346 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000203003  decreased coverage  0.000000325428 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2910  DNA polymerase III subunit delta  37.61 
 
 		 345 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0729  DNA polymerase III subunit delta  32.37 
 
 		 343 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000331026  normal  0.281474 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2986  DNA polymerase III, delta subunit  32.37 
 
 		 343 aa  163  6e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013021  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1189  DNA polymerase III, delta subunit  27.5 
 
 		 331 aa  162  9e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.725755  normal  0.332691 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00609  DNA polymerase III subunit delta  32.37 
 
 		 343 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0200544  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0611  DNA polymerase III subunit delta  33.55 
 
 		 343 aa  162  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000798532  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1185  DNA polymerase III subunit delta  33.92 
 
 		 341 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0666  DNA polymerase III subunit delta  32.37 
 
 		 343 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000205044  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00598  hypothetical protein  32.37 
 
 		 343 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0206116  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0660  DNA polymerase III subunit delta  32.37 
 
 		 343 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000888397  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>