54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1404 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1404  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 389 aa  778    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0811  DNA polymerase III, delta subunit  29.96 
 
 		 387 aa  97.8  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.692629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4252  DNA polymerase III subunit delta  25.78 
 
 		 346 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.400931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3926  DNA polymerase III subunit delta  26.17 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  30.66 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  30.66 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  30.66 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  30.66 
 
 		 336 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  29.63 
 
 		 336 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  29.11 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  29.63 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  29.63 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  29.63 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  29.63 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  28.64 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  25.84 
 
 		 315 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  26.42 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4384  DNA polymerase III subunit delta  25 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  26.14 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  28.44 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  27.45 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1977  DNA polymerase III subunit delta  27.94 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.286095  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0863  DNA polymerase III subunit delta  28.34 
 
 		 347 aa  57  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  28.5 
 
 		 338 aa  57  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2057  DNA polymerase III subunit delta  27.94 
 
 		 347 aa  57  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0639  DNA polymerase III subunit delta  25.82 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.858672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  30.09 
 
 		 329 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  28.71 
 
 		 329 aa  53.1  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0387  DNA polymerase III subunit delta  27.37 
 
 		 342 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1173  DNA polymerase III, delta subunit  23.64 
 
 		 329 aa  50.8  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163613  hitchhiker  0.0000000248106 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  27.62 
 
 		 328 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3200  DNA polymerase III subunit delta  23.75 
 
 		 343 aa  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  28.69 
 
 		 329 aa  49.7  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0286  DNA polymerase III subunit delta  25.99 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0434  DNA polymerase III subunit delta  27.39 
 
 		 342 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  24.79 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0222  DNA polymerase III, delta subunit  22.09 
 
 		 340 aa  47.4  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  30.41 
 
 		 346 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  31.06 
 
 		 306 aa  47  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  23.72 
 
 		 344 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0339  DNA polymerase III, delta subunit  23.91 
 
 		 338 aa  46.6  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00729017 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  25.63 
 
 		 337 aa  46.6  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  26.54 
 
 		 332 aa  46.6  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2834  DNA polymerase III, delta subunit  31.69 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.68901 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  32.77 
 
 		 336 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  25.83 
 
 		 334 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5512  DNA polymerase III, delta subunit  25.84 
 
 		 318 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.504789 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  27 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0169  DNA polymerase III subunit delta  26.05 
 
 		 342 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  30.36 
 
 		 330 aa  44.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  24.56 
 
 		 378 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3317  DNA polymerase III subunit delta  25.57 
 
 		 345 aa  43.5  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  25.24 
 
 		 333 aa  43.5  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1448  DNA polymerase III subunit delta  25.38 
 
 		 342 aa  43.1  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>