70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5512 on replicon NC_011737
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011737  PCC7424_5512  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 318 aa  649    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.504789 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  37.15 
 
 		 329 aa  215  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  36.62 
 
 		 328 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  36.27 
 
 		 324 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  34.67 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  34.67 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  34.88 
 
 		 328 aa  182  6e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  33.12 
 
 		 332 aa  166  6.9999999999999995e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0212  DNA polymerase III subunit delta  32.23 
 
 		 316 aa  165  8e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0072  DNA polymerase III subunit delta  32.15 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00831  DNA polymerase III subunit delta  31.83 
 
 		 336 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  31.82 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0083  DNA polymerase III subunit delta  30.34 
 
 		 319 aa  133  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21151  DNA polymerase III subunit delta  30.36 
 
 		 342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1245  DNA polymerase III subunit delta  30.36 
 
 		 342 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17731  DNA polymerase III subunit delta  31.23 
 
 		 335 aa  129  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18371  DNA polymerase III subunit delta  28.23 
 
 		 333 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.926744  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5666  DNA polymerase III, delta subunit  30.58 
 
 		 319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18561  DNA polymerase III subunit delta  27.63 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.318986  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18371  DNA polymerase III subunit delta  29.34 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1739  DNA polymerase III subunit delta  26.81 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.353532  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  25.51 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  23.2 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  29.03 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  23.24 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  27.24 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  26.21 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  27.24 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  27.24 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  27.24 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  27.24 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  27.24 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  27.24 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  27.24 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  27.24 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  27.24 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  23.24 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  23.91 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  23.53 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  23.4 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  24.44 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  24.02 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  23.48 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  22.94 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  22.94 
 
 		 419 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  24.14 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  23.08 
 
 		 337 aa  53.1  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0868  DNA polymerase III delta  26.01 
 
 		 327 aa  52  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  24.54 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0542  DNA polymerase III subunit delta  24.73 
 
 		 335 aa  49.3  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  23.03 
 
 		 334 aa  49.3  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0462  DNA polymerase III, delta subunit superfamily protein  22.63 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0321349  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  24.16 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  22.48 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  23.72 
 
 		 330 aa  46.6  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  20.71 
 
 		 339 aa  46.6  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  21.72 
 
 		 339 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  21.88 
 
 		 332 aa  46.6  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  22.06 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1819  DNA polymerase III subunit delta  23.05 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0075815  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  23.5 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  22.66 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  24.6 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  21.98 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  23.1 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  22.6 
 
 		 315 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  25.17 
 
 		 345 aa  44.3  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  20.13 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  25.81 
 
 		 324 aa  43.1  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  25.81 
 
 		 324 aa  43.1  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>