78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0787 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 		 345 aa  692    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  68.62 
 
 		 344 aa  484  1e-136  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1819  DNA polymerase III subunit delta  41.86 
 
 		 334 aa  230  2e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0075815  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  29.39 
 
 		 344 aa  126  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  26.54 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  31.06 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  26.38 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  31.06 
 
 		 336 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  31.06 
 
 		 336 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  31.06 
 
 		 336 aa  113  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  31.06 
 
 		 336 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  30.72 
 
 		 336 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  30.72 
 
 		 336 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  30.72 
 
 		 336 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  30.72 
 
 		 336 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  31.06 
 
 		 336 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  30.58 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  25.66 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  28.52 
 
 		 333 aa  94  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  27.49 
 
 		 334 aa  93.6  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  26.81 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  26.81 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  27.5 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  24.73 
 
 		 335 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  24.61 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  24.5 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1173  DNA polymerase III, delta subunit  29.73 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163613  hitchhiker  0.0000000248106 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  23.23 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  23.58 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  23.81 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  24.48 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  25.09 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  22.18 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  24.19 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  21.95 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  28.12 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  27.68 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  25.76 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  24.14 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  24.71 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  23.37 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  20.62 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  24.5 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  22.3 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  22.9 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0212  DNA polymerase III subunit delta  21.62 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  23.79 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  27.74 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  21.58 
 
 		 331 aa  53.9  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  24.31 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  24.52 
 
 		 315 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  23.15 
 
 		 324 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  23.42 
 
 		 329 aa  53.5  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl368  hypothetical protein  20.16 
 
 		 319 aa  50.8  0.00003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.42314e-33  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  23.58 
 
 		 325 aa  51.2  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00831  DNA polymerase III subunit delta  21.34 
 
 		 336 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1185  DNA polymerase III, delta subunit  22.37 
 
 		 337 aa  50.4  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  23.4 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  23.4 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  24.02 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  22.9 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  22.15 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  21.51 
 
 		 330 aa  47.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  25.47 
 
 		 334 aa  46.2  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2496  DNA polymerase III, delta  27.59 
 
 		 330 aa  46.2  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  29.55 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  24.1 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3137  DNA polymerase III, delta  26.21 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.226338  hitchhiker  0.0000037205 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  22.22 
 
 		 321 aa  44.3  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  20.86 
 
 		 350 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  22.83 
 
 		 344 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5512  DNA polymerase III, delta subunit  25.17 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.504789 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  22.14 
 
 		 317 aa  43.9  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21151  DNA polymerase III subunit delta  22.9 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0772  hypothetical protein  21.38 
 
 		 316 aa  43.5  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.421798  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0838  DNA polymerase III, delta subunit  26.32 
 
 		 330 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  24.59 
 
 		 312 aa  43.1  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18371  DNA polymerase III subunit delta  23.03 
 
 		 333 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>