81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0761 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 		 344 aa  688    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  68.62 
 
 		 345 aa  484  1e-136  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1819  DNA polymerase III subunit delta  40.18 
 
 		 334 aa  238  9e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0075815  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  28.43 
 
 		 344 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  25.24 
 
 		 348 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  28.33 
 
 		 336 aa  119  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  29.55 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  29.21 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  29.21 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  29.21 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  29.21 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  28.87 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  28.87 
 
 		 336 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  28.87 
 
 		 336 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  28.87 
 
 		 336 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  28.87 
 
 		 336 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  26.5 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  26.27 
 
 		 333 aa  106  6e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  24.49 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  26.23 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  25.16 
 
 		 324 aa  93.2  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  25.16 
 
 		 324 aa  93.2  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  26.2 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  26.89 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  21.14 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  23.63 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  20.48 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  24.62 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  23.89 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  22.3 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  22.61 
 
 		 337 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  24.85 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1173  DNA polymerase III, delta subunit  26.5 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163613  hitchhiker  0.0000000248106 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  22.89 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  21.58 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  21.99 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  23.38 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  22.18 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  23.02 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  23.37 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  24.06 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  24.06 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  21.05 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  21.18 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  20.78 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  22.03 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  21.14 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  20.3 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  21.87 
 
 		 332 aa  54.3  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1185  DNA polymerase III, delta subunit  20.82 
 
 		 337 aa  54.3  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0212  DNA polymerase III subunit delta  23.13 
 
 		 316 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  20.07 
 
 		 330 aa  52.8  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  23.29 
 
 		 329 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  21.55 
 
 		 327 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  21.55 
 
 		 327 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  22.44 
 
 		 320 aa  49.7  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  20.83 
 
 		 331 aa  49.3  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl368  hypothetical protein  21.4 
 
 		 319 aa  49.3  0.00009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.42314e-33  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0072  DNA polymerase III subunit delta  21.18 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00831  DNA polymerase III subunit delta  23.15 
 
 		 336 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  22.81 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12440  DNA polymerase III, delta subunit  21.88 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203264  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18371  DNA polymerase III subunit delta  22.89 
 
 		 333 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  24.24 
 
 		 334 aa  47  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0772  hypothetical protein  20.76 
 
 		 316 aa  46.6  0.0007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.421798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  16.56 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  18.29 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  25.81 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  23.27 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  21.37 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  24.14 
 
 		 341 aa  44.7  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  20.44 
 
 		 338 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  21.65 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  20.08 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21151  DNA polymerase III subunit delta  22.19 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5666  DNA polymerase III, delta subunit  24.46 
 
 		 319 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  19.7 
 
 		 336 aa  44.3  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0335  DNA polymerase III, delta subunit superfamily  22.34 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.874049  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  29.13 
 
 		 317 aa  43.1  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  22.89 
 
 		 317 aa  42.7  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>