86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0965 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 
331 aa  654    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  34.45 
 
 
333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  34.97 
 
 
343 aa  168  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  28.74 
 
 
344 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  29.27 
 
 
348 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  29.73 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  28.53 
 
 
336 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  28.53 
 
 
336 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  28.53 
 
 
336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  28.53 
 
 
336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  28.53 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  28.53 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  28.53 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  28.53 
 
 
336 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  28.53 
 
 
336 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  28.53 
 
 
336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  28.61 
 
 
329 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  28.61 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  28.62 
 
 
330 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  25.23 
 
 
331 aa  93.6  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  25.09 
 
 
324 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  25.09 
 
 
324 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  26.3 
 
 
324 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  27.02 
 
 
323 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  23.05 
 
 
335 aa  86.3  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  25.15 
 
 
330 aa  86.3  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  26.03 
 
 
334 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  24.77 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  28.18 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  25 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  26.4 
 
 
338 aa  75.9  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  24.47 
 
 
337 aa  75.9  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  21.52 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  23.87 
 
 
325 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  25.93 
 
 
334 aa  72.8  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  21.75 
 
 
332 aa  72.4  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  23.2 
 
 
378 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  24.43 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  24.81 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  22.84 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  23.81 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1819  DNA polymerase III subunit delta  25.88 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0075815  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  22.88 
 
 
306 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  26.29 
 
 
324 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  21.99 
 
 
339 aa  62.4  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  26.32 
 
 
336 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1173  DNA polymerase III, delta subunit  25.84 
 
 
329 aa  60.5  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163613  hitchhiker  0.0000000248106 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1185  DNA polymerase III, delta subunit  23.77 
 
 
337 aa  60.1  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  21.43 
 
 
342 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5666  DNA polymerase III, delta subunit  28 
 
 
319 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2524  DNA polymerase III, delta subunit  31.82 
 
 
311 aa  56.6  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  23.33 
 
 
334 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  21.65 
 
 
374 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  24.53 
 
 
330 aa  54.7  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5512  DNA polymerase III, delta subunit  24.14 
 
 
318 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.504789 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2387  DNA polymerase III subunit delta  26.7 
 
 
312 aa  54.3  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.778182  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  22.26 
 
 
338 aa  54.3  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  22.46 
 
 
329 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf317  DNA polymerase III, delta subunit  26.06 
 
 
322 aa  53.1  0.000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102527  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0083  DNA polymerase III subunit delta  21.18 
 
 
319 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  22.02 
 
 
342 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  24.5 
 
 
334 aa  51.2  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  22.78 
 
 
323 aa  50.4  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  22.08 
 
 
323 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  22.86 
 
 
328 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  20.07 
 
 
344 aa  49.7  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  24.15 
 
 
354 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  22.01 
 
 
332 aa  49.3  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  20.83 
 
 
344 aa  49.3  0.00008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0224  DNA polymerase III, delta subunit  23.08 
 
 
346 aa  48.5  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  26.43 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  23.11 
 
 
328 aa  47.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01876  DNA polymerase III subunit delta  22.32 
 
 
342 aa  47.4  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.84431  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  19.94 
 
 
419 aa  47.4  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  23.23 
 
 
331 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  20.9 
 
 
328 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0212  DNA polymerase III subunit delta  28.28 
 
 
316 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2910  DNA polymerase III subunit delta  22.37 
 
 
345 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0179  DNA polymerase III, delta subunit  30 
 
 
331 aa  45.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl368  hypothetical protein  22.26 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.42314e-33  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  24.1 
 
 
345 aa  45.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  25.81 
 
 
315 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17841  DNA polymerase, gamma and tau subunits  28.83 
 
 
578 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  24.2 
 
 
338 aa  43.5  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  18.39 
 
 
399 aa  42.7  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0772  hypothetical protein  28.22 
 
 
316 aa  42.7  0.008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.421798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>