49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2387 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2387  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 		 312 aa  615  1e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.778182  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2524  DNA polymerase III, delta subunit  68.09 
 
 		 311 aa  403  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  36.42 
 
 		 312 aa  139  7e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  26.83 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  28.03 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5666  DNA polymerase III, delta subunit  27.27 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  28.03 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  28.22 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  28.25 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  23.89 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  29.38 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  28.22 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  27.72 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  27.72 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  27.72 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  29.64 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  26.11 
 
 		 336 aa  57  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  27.72 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  27.72 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  27.72 
 
 		 336 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  27.72 
 
 		 336 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  27.72 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  27.72 
 
 		 336 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  30.06 
 
 		 350 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  26.7 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  30.77 
 
 		 337 aa  52.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  24.8 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  24.8 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  23.71 
 
 		 331 aa  49.7  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  23.58 
 
 		 323 aa  48.5  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  23.05 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  24.15 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  25.41 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2157  DNA polymerase III, delta subunit  24.9 
 
 		 338 aa  47.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  25.76 
 
 		 346 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  30.11 
 
 		 319 aa  47  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  23.27 
 
 		 324 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  23.27 
 
 		 324 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  23.68 
 
 		 323 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  30.85 
 
 		 333 aa  46.2  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  29.41 
 
 		 343 aa  46.2  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  30.07 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  28.46 
 
 		 378 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  21.17 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  31.43 
 
 		 332 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2917  DNA polymerase III, delta subunit  25.31 
 
 		 342 aa  43.5  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1819  DNA polymerase III subunit delta  27.87 
 
 		 334 aa  43.1  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0075815  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  25.31 
 
 		 342 aa  42.7  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  23.21 
 
 		 324 aa  42.4  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>